Un logiciel d’analyse de tomates révèle la diversité phénotypique des piments du Nouveau-Mexique

Une equipe de recherche internationale cree des composes azotes jusque la

Le Nouveau-Mexique est l’un des plus grands producteurs de piment (Capsicum spp.) aux États-Unis, avec 51 000 tonnes de production en 2021 sur une superficie de 8 500 acres avec une productivité moyenne de 6 tonnes/acre selon le US Department of Agriculture National Service des statistiques agricoles. La productivité moyenne a diminué de 25 % alors que la superficie consacrée à la production de piment rouge est restée la même. Cela a entraîné une réduction de l’activité économique de près de 10 % en 2020 par rapport à l’année précédente, passant de 50,1 millions de dollars à 44,9 millions de dollars. Cette baisse significative de la production totale de piment dans l’État a incité les scientifiques à de nouveaux efforts de modernisation visant à accélérer le gain génétique et à améliorer la productivité dans le programme NMSU Chili Pepper Breeding and Genetics en évaluant différents traits liés au rendement et au potentiel de rendement à l’aide de hauts- des outils de phénotypage à haut débit tels que le Tomato Analyzer (TA).

L’architecture des fruits et les traits liés à la morphologie font partie des déterminants de la diversité des fruits et sont des contributeurs majeurs au rendement et au potentiel de rendement du piment. À l’aide du logiciel TA, les scientifiques ont collecté des données sur un ensemble d’attributs de fruits, notamment le périmètre des fruits, les indices de forme, la taille et l’asymétrie dans une collection de diverses lignées de piments rouges évaluées dans les conditions de croissance du Nouveau-Mexique.

Les chercheurs visaient à caractériser 105 génotypes d’un panel de diversité Capsicum composé de cultivars, de lignées généalogiques, de variétés locales et d’espèces sauvages appartenant à 12 types de gousses (fruits) différents, pour 32 descripteurs morphométriques de TA. L’analyse hiérarchique des grappes a regroupé les génotypes en huit grappes en fonction des descripteurs TA. Les mesures de base, à savoir le périmètre, la surface, la largeur à mi-hauteur, la largeur maximale, la hauteur à mi-largeur, la hauteur maximale et la hauteur incurvée, étaient les descripteurs les plus discriminants avec une contribution maximale à la forme globale du fruit.

L’utilité des descripteurs morphométriques TA, difficiles à mesurer par phénotypage conventionnel, a été démontrée. Plusieurs cultivars avec la forme et la morphologie des fruits souhaitées sur la base d’analyses de grappes ont été recommandés comme lignées parentales pour l’hybridation afin d’améliorer le rendement dans les programmes de sélection du piment. Les résultats de l’utilisation de l’AT pour mesurer les caractères liés aux fruits fourniront une base pour une étude d’association à l’échelle du génome et une sélection génomique pour le rendement et les caractères contribuant au rendement chez le piment du Nouveau-Mexique.

Les résultats complets de l’étude peut être trouvé sur l’ASHS HortScience site Web de la revue électronique.

Plus d’information:
Ehtisham S. Khokhar et al, Caractérisation à haut débit de la diversité phénotypique des fruits parmi le nouveau piment mexicain (Capsicum spp.) À l’aide du logiciel Tomato Analyzer, HortScience (2022). DOI : 10.21273/HORTSCI16815-22

Fourni par l’American Society for Horticultural Science

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