Les bactéries résistantes aux antibiotiques et les gènes transmis entre les chiens et les chats sains et leurs propriétaires

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Des chiens et des chats de compagnie en bonne santé pourraient transmettre à leurs propriétaires des bactéries résistantes aux antibiotiques ainsi que des gènes qui jouent un rôle clé dans la résistance bactérienne, selon une nouvelle étude qui sera présentée cette année au Congrès européen de microbiologie clinique et des maladies infectieuses (ECCMID) à Lisbonne, Portugal (23-26 avril). L’étude est menée par le Dr Juliana Menezes de l’Université de Lisbonne au Portugal et le Dr Sian Frosini du Royal Veterinary College, au Royaume-Uni, et leurs collègues.

« Nos résultats vérifient non seulement le partage de bactéries résistantes aux antibiotiques, mais également de gènes de résistance entre les animaux de compagnie et leurs propriétaires dans la communauté, soulignant la nécessité de programmes de surveillance locaux continus pour identifier le risque potentiel pour la santé humaine », déclare le Dr Menezes de l’Université de Lisbonne.

Le rôle des animaux de compagnie en tant que réservoirs potentiels de bactéries résistantes aux antimicrobiens est une préoccupation croissante dans le monde entier. Escherichia coli (E. coli) les bactéries sont courantes dans les intestins des personnes et des animaux en bonne santé. Il existe un certain nombre de types différents et, bien que la majorité soit inoffensive, certaines peuvent provoquer de graves intoxications alimentaires et des infections potentiellement mortelles, y compris des intoxications sanguines, avec plus de 40 000 cas chaque année rien qu’en Angleterre.

Les infections causées par des souches hautement résistantes à BLSE et productrices d’AmpC sont particulièrement importantes. Entérobactéries (AmpC-E) et producteur de carbapénèmase Entérobactéries (CPE), qui résistent à plusieurs antibiotiques, dont la pénicilline et les céphalosporines.

Dans cette étude, les chercheurs ont voulu savoir comment ces bactéries résistantes se propagent et s’il existe un croisement entre les animaux de compagnie sains (c’est-à-dire les chats et les chiens) et leurs propriétaires.

La santé des animaux de compagnie a été évaluée par leur vétérinaire lorsqu’ils fréquentaient le Small Animal Veterinary Teaching Hospital de l’Université de Lisbonne et le Royal Veterinary College Small Animal Veterinary Referral Service du Royal Veterinary College au Royaume-Uni. Seuls les animaux et leurs propriétaires qui n’avaient pas connu d’infections bactériennes ou pris d’antibiotiques dans les 3 mois précédant le début de l’étude ont été recrutés.

Des échantillons de selles ont été prélevés sur 58 personnes en bonne santé et les 18 chats et 40 chiens qui vivaient avec eux dans 41 foyers au Portugal, et sur 56 personnes en bonne santé et 45 chiens dans 42 foyers au Royaume-Uni.

Des échantillons ont été prélevés à intervalles mensuels pendant quatre mois, et le séquençage génétique a été utilisé pour identifier à la fois les espèces de bactéries dans chaque échantillon et la présence de gènes de résistance aux médicaments.

Les chercheurs ont utilisé Rep-PCR, une technique d’empreinte moléculaire rapide et simple à utiliser qui aide à identifier les souches de bactéries apparentées. Parce qu’il n’est pas aussi sensible que le séquençage du génome entier, ils ont également séquencé les souches pour confirmer le partage possible de bactéries résistantes.

Entre 2018 et 2020, 15 animaux de compagnie sur 103 (15 % ; 1 chat et 14 chiens) et 15 membres des ménages sur 114 (13 %) des deux pays étaient porteurs de bactéries productrices de BLSE/AmpC. Parmi ceux-ci, près de la moitié des chats et des chiens (6 au Portugal et 1 au Royaume-Uni) et un tiers des membres du ménage (4 au Portugal et 1 au Royaume-Uni) ont été colonisés par au moins une souche multirésistante (voir tableau 1 dans les notes aux éditeurs).

Aucune entérobactérie résistante aux carbapénèmes ou Acinetobacter spp ont été détectés dans n’importe lequel des échantillons.

Dans quatre foyers portugais, les gènes de résistance BLSE/pAMPc trouvés chez les animaux de compagnie correspondaient à ceux trouvés dans les échantillons de selles de leur propriétaire. Dans trois de ces ménages, les gènes de résistance appariés n’ont été récupérés qu’à un moment donné (voir la figure 2 dans les notes aux éditeurs), mais dans un ménage, des souches de partage ont été notées à deux moments consécutifs suggérant une colonisation persistante de bactéries partagées.

De plus, dans deux des ménages, les microbes des animaux de compagnie correspondaient E. coli souches trouvées dans l’échantillon de selles de leur propriétaire, mais dans les deux autres, il n’y avait aucune preuve de partage de bactéries (voir figure 3 dans les notes aux éditeurs).

« Parfois, les bactéries peuvent ne pas être partagées, mais leurs gènes de résistance peuvent l’être », explique le Dr Menezes. « Ces gènes se trouvent dans des morceaux mobiles d’ADN, ce qui signifie qu’ils peuvent être transférés entre différentes populations bactériennes chez les animaux et les humains. »

Elle poursuit : « Même avant la pandémie de COVID-19, la résistance aux antibiotiques était l’une des plus grandes menaces pour la santé publique, car elle peut rendre incurables des conditions telles que la pneumonie, la septicémie, les infections des voies urinaires et des plaies. Bien que le niveau de partage des ménages que nous avons étudié est faible, les porteurs sains peuvent excréter des bactéries dans leur environnement pendant des mois, et ils peuvent être une source d’infection pour d’autres personnes et animaux plus vulnérables tels que les personnes âgées et les femmes enceintes.Nos résultats renforcent la nécessité pour les gens de pratiquer une bonne hygiène autour leurs animaux de compagnie et de réduire l’utilisation d’antibiotiques inutiles chez les animaux de compagnie et les humains. »

Il s’agit d’une étude observationnelle et ne peut pas prouver qu’un contact étroit avec des animaux de compagnie provoque une colonisation par des bactéries résistantes aux antibiotiques, mais ne fait que suggérer la possibilité d’un tel effet. Les auteurs soulignent plusieurs limites, notamment le fait qu’il impliquait un petit nombre de familles et que le suivi longitudinal était limité.

Fourni par la Société européenne de microbiologie clinique et des maladies infectieuses

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