UN Une nouvelle souche d’Omicron appelée XE se répand au Royaume-Uni et certains cas ont également été identifiés ailleurs dans le monde. Voici ce que nous savons – et ne savons pas – sur la variante.
Alors, que savons-nous de la variante XE jusqu’à présent ?
XE est un hybride des deux souches maintenant connues d’Omicron : BA.1 (la souche originale d’Omicron) et BA.2 (la souche apparentée la plus contagieuse maintenant répandue aux États-Unis et dans d’autres pays). XE est connu comme une variante recombinante qui apparaît « lorsqu’une souche de SARS-CoV-2 ingère du matériel génétique d’une autre souche de SARS-CoV-2 », explique le Dr. Andrew Badley, professeur de maladies infectieuses à la Mayo Clinic et président du groupe de travail SARS-CoV-2 COVID-19 pour la Mayo Clinic. Cela signifie que la nouvelle variante recombinante reprendra les traits associés à chaque souche, mais ne se transformera pas toujours en une version plus menaçante. « Les variantes recombinantes sont bien décrites pour d’autres virus et ne sont pas souvent associées à un plus grand danger », explique Badley.
Selon l’Agence britannique de sécurité sanitaire (UKHSA), XE a trois mutations qui ne sont pas présentes dans toutes les souches BA.1 ou BA.2.
Les experts disent que puisque BA.1 et BA.2 sont largement utilisés en ce moment, il n’est pas surprenant qu’une nouvelle souche combinée ait récemment émergé. « Les variantes recombinantes ne sont pas un événement rare, en particulier lorsque plusieurs variantes circulent et que plusieurs ont été identifiées au cours de la pandémie à ce jour », a déclaré Susan Hopkins, conseillère médicale en chef de l’UKHSA, dans un communiqué. « Comme avec d’autres types de variantes[s]la plupart mourront assez rapidement.
Les chercheurs étudient toujours la facilité avec laquelle la variante XE se propage. Des chercheurs britanniques ont découvert que la variante était à peu près aussi transmissible que BA.2 lorsque les séquences XE ont été analysées pour la première fois, mais des données plus récentes suggèrent que la variante pourrait être 10% plus transmissible. Le rapport de l’Organisation mondiale de la santé (OMS) du 5 avril indique également que XE est environ 10% plus transmissible que BA.2, mais note que le nombre doit être confirmé.
Où les cas ont-ils été trouvés ?
Le premier cas connu de XE a été détecté au Royaume-Uni le 19 janvier 2022. Plus de 600 cas de XE y ont été identifiés à ce jour – moins de 1% de tous les cas séquencés, selon un rapport de l’UKHSA du 25 mars. C’est loin du taux de cas causés par BA.2, qui est maintenant la forme dominante de SRAS-CoV-2 au Royaume-Uni et dans le monde.
XE a également été trouvé en Inde et en Thaïlande. Selon Bloomberg, un cas a été signalé à Mumbai le 6 avril et le 4 avril, le Centre de génomique médicale de Bangkok a signalé un nouveau cas de XE.
Faut-il s’inquiéter ?
« Comme tout à l’ère du SRAS-CoV-2, il n’y a pas de réponse facile », déclare Badley. «Mais pour faire simple: si vous êtes vacciné et en bonne santé, vous ne devriez pas vous en soucier. Si vous n’êtes pas vacciné ou avez des comorbidités, il y a lieu de s’inquiéter.
La bonne nouvelle est qu’il y a encore relativement peu de cas XE. « Nous connaissons l’existence de la variante XE depuis la mi-janvier », déclare Badley. « Maintenant, deux mois et demi plus tard, nous voyons toujours des cas, mais cela n’a pas explosé. » Pour mettre cela en contexte, « Omicron a été identifié pour la première fois en novembre et en quatre semaines, il était partout dans le monde. Ce n’est donc pas une nouvelle souche aussi dominante que l’était Omicron », dit-il.
Que ne savons-nous pas encore ?
Il n’y a pas encore suffisamment d’informations pour dire si XE se propagera plus rapidement ou provoquera une maladie plus grave que d’autres variantes du SRAS-CoV-2. « Jusqu’à présent, il n’y a pas suffisamment de preuves pour tirer des conclusions sur la transmissibilité, la gravité ou l’efficacité du vaccin », a déclaré Susan Hopkins, conseillère médicale principale de l’UKHSA, dans un communiqué.
Cependant, il est possible de tirer quelques indices des deux tribus qui la composent. « Nous savons que les vaccins sont efficaces pour protéger contre les maladies symptomatiques pour BA.1 et BA.2, et nous avons donc toutes les raisons de croire que les stratégies de vaccination seront efficaces pour protéger contre les maladies symptomatiques causées par XE », explique Badley. Un autre indice est que « BA.1 et BA.2 peuvent chacun échapper à certaines des thérapies par anticorps monoclonaux », de sorte que ces médicaments ne fonctionnent probablement pas aussi bien contre XE non plus, dit Badley. « Nous savons également que les autres thérapies utilisées notamment en ambulatoire – Paxlovid et Molnupiravir – devraient continuer à être efficaces contre la souche XE en fonction de leur mode d’action. »
L’UKHSA surveille actuellement XE et deux autres lignées recombinantes – XF et XD, qui sont toutes deux des recombinants de Delta et Omicron BA.1. Selon l’UKHSA, moins de 40 cas de XF ont été détectés jusqu’à présent, tous au Royaume-Uni (bien qu’aucun n’ait émergé depuis la mi-février). XD n’a pas été trouvé au Royaume-Uni, mais 49 cas – principalement en France – ont été signalés dans des bases de données mondiales. L’Organisation mondiale de la santé suit également XE, XD et d’autres recombinants, selon le dernier rapport du groupe.
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