Les chercheurs du Laboratoire national d’Oak Ridge, de l’Université du Tennessee à Chattanooga et de l’Université de Tuskegee ont utilisé les mathématiques pour prédire quelles zones de la protéine de pointe du SRAS-CoV-2 sont les plus susceptibles de muter.
Dans une étude publiée dans Polymèresl’équipe a analysé la topologie de plus de 13 000 structures de la banque de données sur les protéines et a découvert que les mutations de la protéine de pointe du virus étaient plus susceptibles de se produire dans les zones à haute énergie libre topologique, ce qui rend une protéine moins stable.
La variante omicron du SRAS-CoV-2 a muté dans une zone compatible avec les calculs des chercheurs, confirmant les résultats de l’article.
Cette méthodologie permet aux scientifiques de prédire où les mutations protéiques peuvent se produire à l’aide de mathématiques et pourraient être appliquées à n’importe quelle protéine, ouvrant potentiellement la porte à une meilleure compréhension de la dynamique virale et à des thérapies médicamenteuses plus efficaces.
« Nous pensons que l’approche est indépendante des virus », a déclaré Bobby Sumpter de l’ORNL. « Tout est basé sur la topologie des protéines. »
Quenisha Baldwin et al, L’énergie libre topologique locale de la protéine de pointe SARS-CoV-2, Polymères (2022). DOI : 10.3390/polym14153014