Une nouvelle étude menée par l’Université d’Oxford a révélé que l’évolution naturelle des gènes de résistance aux antibiotiques a maintenu la résistance des bactéries malgré une réduction de l’utilisation des antibiotiques. Les résultats démontrent l’importance de comprendre l’évolution régulatrice des gènes de résistance pour combattre stratégiquement la RAM.
L’étude intitulée « Le réglage fin de la réglementation sur mcr-1 augmente la condition physique bactérienne et stabilise la résistance aux antibiotiques en milieu agricole » a été publiée dans le Journal de la Société internationale pour l’écologie microbienne.
La résistance aux antimicrobiens (RAM) constitue une menace sérieuse et croissante pour la santé mondiale, avec 1,2 million de personnes qui meurent chaque année à cause d’infections pharmacorésistantes. La surutilisation et le mauvais usage des antibiotiques sont un facteur majeur de la RAM, et il existe un besoin urgent de protéger l’efficacité des antibiotiques de « dernière intention » pour traiter les infections multirésistantes.
« Notre étude montre comment l’évolution peut rapidement stabiliser les gènes de résistance dans les populations d’agents pathogènes, réduisant ainsi l’impact de la restriction de la consommation d’antibiotiques. Limiter la consommation est l’une des stratégies les plus largement préconisées pour lutter contre la RAM, et la principale leçon de nos travaux est que nous avons besoin de nouveaux , des stratégies innovantes pour éliminer activement les bactéries RAM », déclare le professeur Craig MacLean, département de biologie, Université d’Oxford
En 2017, le gouvernement chinois a interdit l’utilisation de la colistine, un antibiotique de dernière intention, comme stimulateur de croissance dans l’alimentation animale, en réponse à la propagation rapide de la bactérie Escherichia coli (E.coli) résistante aux antibiotiques, porteuse de gènes mobiles de résistance à la colistine (MCR). Les bactéries porteuses des gènes MCR sont résistantes au traitement à la colistine et provoquent des infections résistantes aux médicaments difficiles à traiter chez les humains et les animaux.
L’interdiction a entraîné une réduction de 90 % de la consommation de colistine, et les scientifiques s’attendaient à une baisse correspondante des taux de RAM. En effet, le gène MCR est associé à des coûts liés à la condition physique, tels qu’une capacité compétitive et une virulence réduites. Cependant, des études de surveillance à grande échelle menées à travers la Chine à la suite de l’interdiction ont révélé que le déclin du gène mcr-1 était plus lent que prévu.
Des chercheurs de l’Université d’Oxford dirigés par Maclean ont exploré cette divergence en se concentrant sur la région régulatrice de l’ADN qui contrôle l’expression du gène mcr-1. Ils ont découvert que cette région présentait des niveaux de variation élevés et que certaines variantes étaient capables de compenser les coûts de fitness du gène mcr-1. En « affinant » l’expression de mcr-1 à un niveau inférieur, ces variantes ont permis aux bactéries d’atteindre des taux de croissance élevés tout en augmentant simultanément la résistance à la colistine.
Les chercheurs ont ensuite analysé les données de séquence d’ADN d’E.coli portant mcr-1 avant et après l’interdiction de la colistine. Cela a révélé que les mutations réglementaires qui augmentaient la condition physique en laboratoire étaient restées stables dans les populations d’E.coli provenant des fermes et n’avaient pratiquement pas diminué en réponse à l’interdiction.
Le chercheur principal MacLean a déclaré : « Nos résultats fournissent des preuves solides que l’évolution du gène mcr-1 a contribué à stabiliser la résistance à la colistine en milieu agricole, même si l’utilisation de la colistine en agriculture a diminué de 90 %. Cette découverte est d’une importance majeure pour tous. futures interventions visant la réduction de l’utilisation d’antibiotiques, démontrant la nécessité de considérer l’évolution et la transmission des gènes de résistance pour introduire des stratégies viables pour réduire la résistance.
Le professeur Tim Walsh, directeur de la biologie à l’Ineos Oxford Institute et co-auteur de l’article, a déclaré : « La résistance à la colistine dans de nombreuses souches d’E.coli et dans divers environnements, des élevages de porcs aux services hospitaliers, devrait nous avertir des dangers. de la surutilisation et du mauvais usage des antibiotiques. En termes simples, il ne suffit pas de réduire la consommation d’antibiotiques pour lutter efficacement contre la résistance aux antibiotiques. Nous avons besoin d’approches urgentes et innovantes pour lutter contre la résistance aux antibiotiques, ainsi que de nouvelles stratégies pour protéger nos antibiotiques de dernier recours lorsque nous en avons besoin. eux le plus. »
Plus d’information:
Lois Ogunlana et al, Le réglage fin de la réglementation de mcr-1 augmente la condition physique bactérienne et stabilise la résistance aux antibiotiques en milieu agricole, La revue ISME (2023). DOI : 10.1038/s41396-023-01509-7