Ces dernières années, les scientifiques ont découvert plusieurs associations entre la communauté de micro-organismes qui vivent dans notre intestin et notre état physique et mental. Dans ce sens, l’association entre le microbiote et les troubles du spectre autistique (TSA) était déjà connu de ces experts, mais Revue Nature Microbiologie a publié ce lundi l’une des plus grandes études préparées à cet égard.
Plus précisément, ces derniers travaux soutiennent que les composants bactériens et non bactériens spécifiques du microbiote intestinal et leurs fonctions peuvent contribuer aux TSA chez les garçons et les filles. « Le fait que les enfants atteints du spectre autistique aient un microbiote intestinal différent est connu depuis longtemps, mais « La plupart des études sont basées sur l’analyse de la composante bactérienne et au niveau de la composition taxonomique. »explique Toni Gabaldón au Science Media Center (SMC).
Gabaldón, professeur de recherche à l’ICREA et chef du groupe de génomique comparée à l’Institut de recherche biomédicale (IRB Barcelone) et au Centre de calcul informatique de Barcelone (BSC-CNS), souligne la bonne méthodologie et le nombre élevé de participants à l’étude. Au total, les auteurs de l’étude ont séquencé des échantillons fécaux provenant de 1 627 enfants avec ou sans TSA âgés de un à 13 ans en Chine.
L’objectif de la recherche était observer des changements dans la composition des bactéries intestinales chez les personnes atteintes de TSA par rapport aux individus neurotypiques qui ne vivent pas avec un TSA. Pour ce faire, les chercheurs ont analysé ces échantillons par rapport à des données sur d’autres facteurs tels que l’alimentation, les médicaments et d’autres maladies que les participants pourraient manifester. Finalement, ils ont réussi à identifier 14 archées, 51 bactéries, 7 champignons, 18 virus, 27 gènes microbiens et 12 voies métaboliques altérées chez les enfants atteints de TSA.
Les habitudes alimentaires
Mais quelle est l’origine de ces différences au niveau du microbiote ? Comme l’explique Mireia Vallès Colomer, responsable du groupe de recherche sur le microbiome à la Faculté de médecine et des sciences de la vie de l’Université Pompeu Fabra, une étude 2021 a suggéré que cela pourrait avoir à voir avec le régime alimentaire. « Les garçons et les filles autistes présentent souvent des comportements de rejet ou d’évitement de certains aliments, ce qui peut conduire à un régime alimentaire plus restrictif. »
Vallès confirme que la nouvelle étude, dirigée par Siew Ng, souligne une fois de plus que l’alimentation est à l’origine d’une partie des altérations du microbiome, « mais même après avoir contrôlé ce facteur, des différences continuent d’être détectées ». Pour arriver à cette conclusion, Vallès explique que les auteurs de l’étude Ils ont réanalysé les données d’études précédentes ainsi que les données de nouveaux échantillons, dans lequel se trouvaient des archées, des virus et des champignons, types d’échantillons que d’autres études ignorent généralement.
« Bien que la méthodologie présente certains points discutables, les données sont accessibles au public, ce qui permettra à d’autres équipes de vérifier si elles arrivent aux mêmes conclusions »explique Vallès. De son côté, Ruth Ann Luna, directrice de la métagénomique médicale au Microbiome Center du Texas Children’s Hospital et professeure associée au Baylor College of Medicine aux États-Unis, souligne que les valeurs prises en compte par l’équipe de Siew Ng sont cruciales. étudier l’association entre les TSA et le microbiote.
Un modèle à identifier
Maintenant, le scientifique suggère qu’il manque un élément fondamental : « La seule pièce manquante est un profil comportemental complet, ce qui est particulièrement important alors que nous commençons à évaluer combien de ces résultats s’appliquent spécifiquement aux personnes atteintes de TSA sévères ou profonds, explique Luna. » . Finalement, Ng et son équipe ont développé un modèle qui permet l’identification des personnes atteintes de TSA de manière plus précise par rapport aux précédents panels de microbiome intestinal basés sur un seul règne de micro-organismes, tels que les bactéries ou les archées.
Il s’agit d’un panel de 31 microbes et fonctions qui pourrait être utilisé en clinique car il est facile à reproduire. « Le diagnostic actuel de TSA repose sur des modèles de comportement qui apparaissent au fil du temps », explique Gabaldón. « Adopter les premiers biomarqueurs qui pourraient aider Détecter l’autisme plus tôt pourrait faciliter la mise en place de thérapies plus précoces. « S’il existe des changements métaboliques qui influencent la progression des symptômes et pourraient être compensés par un régime alimentaire ou l’utilisation de probiotiques, la modulation du microbiote ouvrirait la porte à de nouveaux traitements améliorant certains aspects. »