Ils l’appellent Legionella bononiensis : c’est la 64e espèce de Legionella identifiée dans le monde, la deuxième à être isolée en Italie depuis la découverte de l’agent pathogène. Il a été découvert en 2019 dans une installation hôtelière par des chercheurs du Laboratoire de microbiologie environnementale et de biologie moléculaire (MAb) de l’Université de Bologne.
Le Laboratoire MAb, basé au Département des sciences biologiques, géologiques et environnementales de l’Université de Bologne, est impliqué dans la surveillance environnementale de la bactérie Legionella, l’espèce bactérienne responsable de la légionellose, une maladie qui affecte principalement les voies respiratoires. La surveillance est réalisée en combinant des techniques traditionnelles et des méthodes moléculaires de pointe, telles que la spectroscopie de masse, le séquençage de gènes et les dernières techniques de séquençage de nouvelle génération (NGS).
« Au cours d’activités de surveillance planifiées dans un établissement hôtelier, le personnel du laboratoire a isolé des colonies atypiques, qui présentaient des caractéristiques morphologiques et phénotypiques particulières », explique Sandra Cristino, chercheuse à l’Université de Bologne et responsable du laboratoire MAb. « Nous avons analysé les échantillons collectés en utilisant toutes les méthodes standardisées suggérées par les normes de référence, ainsi que la littérature scientifique. Cependant, les résultats obtenus étaient discordants et ne permettaient pas l’identification des bactéries au niveau de l’espèce. »
Pour obtenir des réponses plus précises, les chercheurs se sont alors tournés vers le séquençage génétique, le test de référence pour identifier les micro-organismes isolés de manière environnementale ou clinique. Les résultats ont lié la bactérie découverte à une souche de référence de l’espèce Legionella quateirensis.
Pourtant, ce n’était pas une réponse définitive : une enquête plus approfondie était nécessaire. Les chercheurs ont ensuite approfondi l’activité de séquençage en analysant d’autres gènes spécifiques à Legionella. En plus de ces études, les chercheurs ont effectué le phénotypage (c’est-à-dire l’analyse des caractéristiques du micro-organisme), le séquençage du génome entier (une technologie qui permet le séquençage de l’ensemble du génome) et la spectroscopie de masse avec la technologie MALDI-TOF (qui permet l’identification de micro-organismes pathogènes avec une grande précision) études.
« Les résultats obtenus ont confirmé ce que nous avions observé en culture : nous avions affaire à une nouvelle espèce, phylogénétiquement éloignée de Legionella quateirensis, qui n’a jamais été documentée dans la littérature scientifique », poursuit Cristino. « Nous avons alors entamé le processus de reconnaissance officielle de la souche en déposant des échantillons dans deux collections de cultures dans deux pays différents, comme l’exige la principale revue qui permet la description de nouvelles espèces de procaryotes. »
Les collections de cultures sont des collections de cultures microbiennes où sont déposées des souches microbiennes pures pour assurer leur conservation et leur entretien. Ce sont des ressources importantes pour le travail des chercheurs dans les domaines médical et des sciences de la vie. La nouvelle bactérie Legionella a été officiellement déposée dans deux des collections de cultures les plus connues au monde : l’American Type Culture Collection (ATCC), aux États-Unis, et le Leibniz-Institute DSMZ-German Collection of Microorganisms and Cell Cultures (DSMZ), en Allemagne.
La reconnaissance officielle des souches a permis de transmettre les résultats obtenus au Journal international de microbiologie systématique et évolutive (IJSEM). Compte tenu de l’emplacement de la nouvelle souche bactérienne, les scientifiques ont proposé le nom Legionella bononiensis, et après environ un an d’examen par la commission qui garantit la pertinence du nom attribué à la nouvelle espèce, la reconnaissance de la communauté scientifique est enfin arrivée.
L’équipe de recherche de l’Université de Bologne a officiellement annoncé la découverte de la nouvelle espèce lors du 10e Congrès international de Legionella qui s’est tenu à Yokohama, au Japon. Ce travail s’inscrit dans l’axe de recherche du 35e cycle du doctorat. programme en sciences de la terre, de la vie et de l’environnement (STVA) du département des sciences biologiques, géologiques et environnementales de l’université de Bologne. doctorat étudiant Luna Girolamini est le premier auteur de la publication dans le Journal international de microbiologie systématique et évolutive.
Pendant ce temps, le travail des scientifiques du Laboratoire de microbiologie environnementale et de biologie moléculaire (MAb) ne s’arrête pas. « Il est essentiel de continuer à étudier la pathogénicité et l’infectiosité de la souche nouvellement découverte, ainsi que le schéma de résistance aux antibiotiques, afin de pouvoir mener des activités de prévention en santé publique », confirme Cristino. « De plus, le laboratoire travaille sur deux nouveaux isolats, qui s’avèrent être deux nouvelles espèces du genre Legionella. »
Plus d’information:
Luna Girolamini et al, Legionella bononiensis sp. nov., isolé d’un système de distribution d’eau d’un hôtel dans le nord de l’Italie, Journal international de microbiologie systématique et évolutive (2022). DOI : 10.1099/ijsem.0.005512
Fourni par l’Université de Bologne