Une nouvelle carte génétique du caféier arabica, Coffea arabica, pourrait aider les sélectionneurs à développer davantage de des bières résistantes au climat.
Le café est la deuxième boisson la plus consommée sur Terre avec plus de 2 milliards de tasses être apprécié chaque jour. C’est également une matière première précieuse et en 2023, le marché mondial valait plus de 1 000 USD.93 milliards de dollars (74 milliards de livres sterling).
Avec leur goût onctueux supérieur et leurs nombreuses variétés fines, les grains de café arabica représentent environ 60 à 70 % des production mondiale de café. La culture du café soutient également directement les moyens de subsistance des 25 millions d’agriculteurs familiaux avec 100 millions de personnes supplémentaires impliquées dans la transformation et la vente au détail du café.
Mais les cultures de café sont également menacées par le changement climatique dans de nombreuses régions du monde et nous devons recourir à la sélection pour aider les cultures à s’adapter aux nouvelles conditions et à les cultiver dans des zones moins sensibles à des facteurs tels que la sécheresse.
Publié dans Communications naturelles, cette étude pourrait aider à produire des variétés de café avec des rendements plus élevés et une plus grande résilience au changement climatique. Ces nouvelles connaissances n’auraient pas pu arriver à un moment plus important pour la culture du café.
Secrets de la génétique du café
L’étude historique menée par un groupe international de scientifiques a révélé les facteurs génétiques surprenants qui sous-tendent la diversité de centaines d’arabica. variétés de café cultivé dans le monde entier. Les nouveaux travaux, dirigés par une équipe de l’Université d’Udine, en Italie, révèlent également des similitudes surprenantes entre la génétique du café et d’autres cultures importantes, notamment les pommes de terre, les crucifères et le blé.
Ces cultures sont connues sous le nom de tétraploïdes parce qu’ils possèdent quatre copies de chaque gène, au lieu des deux copies (une de chaque parent) que l’on trouve chez les humains et presque tous les autres animaux. Comme indiqué ci-dessous, le génome de l’Arabica contient onze groupes de chromosomes contenant chacun deux copies de chacun de ses parents respectifs, Coffea canephora en bleu et Coffea eugenioides en vert. Dans certains cas, des parties des segments chromosomiques bleus et verts se sont mélangées.
Contrairement aux cultures comestibles comme le blé ou la pomme de terre, qui ont fait l’objet de nombreuses sélections au fil des décennies ou des siècles pour créer des variétés qui sont résistant à la sécheresse ou résistant aux parasites— le café est à la traîne dans l’application des méthodes modernes de sélection.
Cela inclut l’utilisation de techniques plus précises basées sur l’ADN, telles que édition du génome cela implique d’apporter des modifications à l’ADN. Ces méthodes, qui sont également utilisé en médecinenous permettent d’identifier et de manipuler avec précision les parties du génome ou du code génétique d’une culture pour améliorer de nombreux aspects de ses performances.
Avec des informations plus détaillées sur la constitution génétique du café, les chercheurs peuvent commencer à utiliser ces méthodes pour améliorer les variétés de café. L’un des problèmes du café arabica est que nos variétés actuelles ne sont pas très diversifiées.
Cependant, il existe de nombreuses espèces sauvages de café très diverses et l’un des objectifs sera de générer des hybrides plus résilients entre les espèces sauvages et cultivées. Cela permettra aux sélectionneurs de produire une gamme plus large de variétés de café qui pourraient prospérer dans de nombreuses régions du monde.
Un café résistant au climat ?
En 2022, un Étude suisse a montré que les cultures de café arabica sont confrontées à des menaces sans précédent liées au changement climatique, qui pourraient gravement affecter les principales régions productrices telles que le Brésil et l’Éthiopie. Certaines parties de ces régions pourraient devenir impropres à la culture du café en raison de l’augmentation de l’incidence de la sécheresse et des menaces liées à de nouveaux ravageurs ou maladies.
Les sélectionneurs appliquent déjà des méthodes avancées pour développer d’autres cultures résistantes à la sécheresse. À l’avenir, ces technologies pourraient être appliquées au café. En effet, des travaux antérieurs au Portugal et en Amérique latine ont déjà montré que de nouvelles variétés hybrides du Timor oriental présentaient une résistance utile aux maladies et une forme de vigueur accrue appelée hétérosis.
Ces nouvelles connaissances élargiront la capacité de produire de nouveaux hybrides de café qui conviennent à des régions telles que l’Inde et la Nouvelle-Calédonie, où ils pourraient constituer une nouvelle culture pour les agriculteurs.
Alors que les cultures de café sont confrontées à des menaces importantes liées au changement climatique, il est encourageant de constater que nous sommes désormais capables de comprendre la merveilleuse complexité génétique des plants de café avec des détails sans précédent. Les nouvelles connaissances génétiques pourraient également conduire au développement de nouveaux arômes qui diversifieraient davantage l’attrait des cafés dans différentes régions du monde.
Avec le développement d’outils de sélection plus précis pour produire des variétés plus résistantes, le café pourrait être à l’aube d’une nouvelle ère tant pour les agriculteurs que pour les consommateurs.
Plus d’information:
Simone Scalabrin et al, Un assemblage à l’échelle des chromosomes révèle des aberrations et des échanges chromosomiques générant une diversité génétique dans le matériel génétique de Coffea arabica, Communications naturelles (2024). DOI : 10.1038/s41467-023-44449-8
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