Les champignons peuvent provoquer des maladies chez les humains, les animaux et les plantes. Chaque année, 1,5 million de personnes meurent d’infections fongiques et les attaques fongiques des cultures vivrières menacent la production alimentaire. Pour nous protéger, nous avons développé des agents chimiques, sous forme de médicaments ou de pesticides, qui tuent les champignons nuisibles. Le remède le plus efficace contre les infections fongiques est un groupe de substances collectivement appelées azoles.
« Il est essentiel que les azoles que nous utilisons contre les champignons pathogènes aient un effet positif », déclare Ida Skaar, chercheuse principale à l’Institut vétérinaire norvégien.
Les azoles sont en effet fréquemment utilisés comme médicaments pour les humains et les animaux, pour prévenir les maladies fongiques dans les cultures vivrières et sur les terrains de golf, pour préserver le bois, pour prévenir la moisissure dans les bulbes de fleurs et l’ensilage et pour préserver les plantes ornementales. La liste est longue. Cette utilisation fréquente inquiète les chercheurs car le champignon nuisible développe une résistance.
Un sujet peu exploré
La résistance aux antibiotiques est un problème bien connu qui suscite de nombreuses inquiétudes. En comparaison, la résistance aux fongicides est un sujet peu exploré, mais très pertinent. L’Organisation mondiale de la santé (OMS) a, entre autres organismes, identifié le champignon Aspergillus fumigatus comme un champignon pouvant constituer une menace pour la santé à l’avenir. A. fumigatus est un champignon commun que l’on trouve partout et qui ne présente que peu de menace pour les personnes en bonne santé. Pour les personnes dont le système immunitaire est affaibli, cela peut provoquer des infections qui doivent être traitées. Dans de tels cas, il est essentiel que le médicament, généralement à base d’azoles, soit efficace.
« A. fumigatus qui résiste aux azoles constitue un problème mondial croissant », explique Skaar.
« Nous ne savons pas quelle est la situation en Norvège, mais avec le climat plus humide et plus chaud auquel nous pouvons probablement nous attendre à l’avenir, le problème va s’aggraver.
« Il est absolument nécessaire de connaître la situation en Norvège. Nous devons être proactifs et disposer des connaissances nécessaires avant que le problème ne devienne trop grave. Nous devons, entre autres, savoir quel est le degré de résistance que nous avons, de quelle manière le champignon développe une résistance, et dans quels environnements une résistance est susceptible d’apparaître (ce que l’on appelle les hotspots).
One Health : tout est connecté
Skaar dirige le projet NavAzole qui vise à cartographier et comprendre le développement de la résistance aux azoles en Norvège. Cette connaissance est nécessaire pour prendre des décisions judicieuses afin de maintenir le niveau de résistance aussi bas que possible. Cela nécessite une coopération entre différents secteurs.
« La résistance aux azoles concerne plusieurs secteurs. Nous devons donc garder à l’esprit la perspective One Health lorsque nous travaillons avec elle. Cela signifie que nous devons reconnaître le lien important entre la santé humaine, la santé animale et l’environnement. Nous devons considérer toutes les applications « , explique le chercheur principal.
Recherche de résistance chez les champignons vivant dans le sol
L’utilisation de pesticides à base d’azole en agriculture constitue un point chaud potentiel pour le développement d’une résistance. Dans le projet, NIBIO travaillera sur ce problème.
Andrea Ficke est une chercheuse du NIBIO qui travaille sur les maladies fongiques des céréales. Elle explique comment un champ de céréales peut être un point chaud pour le développement de résistances :
« A. fumigatus est un champignon vivant dans le sol qui existe également dans les champs. Dans l’agriculture conventionnelle, les cultures sont pulvérisées contre diverses maladies fongiques et de nombreux fongicides sont à base d’azoles. Certains fongicides finissent dans le sol et » peut affecter A. fumigatus. De la même manière qu’une utilisation élevée d’antibiotiques peut conduire à des bactéries développant une résistance, une exposition régulière aux azoles peut conduire à une résistance chez A. fumigatus. «
Dans le cadre du projet, les chercheurs souhaitent donc déterminer s’ils trouvent des A. fumigatus résistants dans les champs de céréales pulvérisés avec des fongicides à base d’azole et s’il existe une corrélation entre le développement d’une résistance chez les champignons phytopathogènes et le développement d’une résistance chez A. fumigatus.
« Nous allons étudier deux champignons responsables des maladies des feuilles, la tache septorienne (Zymoseptoria tritici) et la tache septorienne (Parastagonospora nodorum). Ces maladies peuvent entraîner une perte considérable de récoltes », explique Ficke.
Ficke travaille sur les maladies des taches foliaires sur les céréales depuis 10 à 12 ans. Durant ces années, elle n’a pas observé d’augmentation inquiétante de la résistance aux fongicides. Jusqu’à présent, le groupe de recherche de Skaar n’a pas non plus trouvé d’A. fumigatus résistant dans les champs. Cela ne signifie pas pour autant que nous pouvons nous reposer sur nos lauriers, bien au contraire.
Le travail préventif est important
« En Norvège, nous avons la chance de ne pas avoir de problèmes majeurs de résistance des cultures aux fongicides », déclare Ficke.
Bien que Skaar ait trouvé des A. fumigatus plus résistants que prévu dans divers environnements norvégiens, elle pense également que le problème est relativement mineur en Norvège. « Mais il n’est pas nécessaire d’aller plus loin qu’au Danemark pour que la situation soit plus grave », ajoute-t-elle.
Les deux chercheurs soulignent l’importance de se concentrer sur cette question en Norvège.
« Les efforts de prévention que nous déployons sont cruciaux. Nous devons comprendre l’ampleur du problème en Norvège et mettre en œuvre des mesures susceptibles de réduire le développement de résistances. Le recours à la lutte antiparasitaire intégrée joue un rôle important à cet égard, en réduisant les utilisation de fongicides. En outre, il convient de considérer dans quelles situations il est nécessaire d’utiliser des fongicides. «
« La Norvège excelle à éviter l’utilisation inutile d’antibiotiques, et nous devrions également nous efforcer d’éviter l’utilisation inutile de fongicides. Lorsque la résistance s’établit correctement, elle est très difficile à éradiquer. Par conséquent, nous devons être proactifs », concluent les chercheurs.
Comment les champignons développent-ils une résistance ?
Dans toutes les populations fongiques, il existe une certaine variation génétique. Cette variation peut rendre certains « individus » plus tolérants que d’autres à l’exposition aux fongicides. Lorsque la population est exposée à des fongicides, ces « individus » survivront et pourront se reproduire. La résistance aux fongicides est génétique, donc héréditaire. Des mutations aléatoires peuvent également se produire dans l’ADN du champignon, le rendant résistant. De cette manière, l’utilisation prolongée du même type de fongicide sélectionnera des champignons de plus en plus résistants. Plus les champignons se reproduisent rapidement, plus la résistance peut apparaître rapidement.
Différents fongicides ont différentes stratégies pour tuer ou inhiber les champignons. Un « individu » qui a développé une résistance à un type de fongicide n’est pas nécessairement résistant à un fongicide qui agit d’une manière différente. Il est donc important d’éviter l’utilisation unilatérale de fongicides ayant le même mode d’action. De plus, dans la production végétale, il faut recourir à la lutte intégrée contre les ravageurs (IPM) pour réduire le besoin de fongicides (et d’autres pesticides).
Fourni par l’Institut norvégien de recherche en bioéconomie