Une étude sur les moustiques sauvages au Burkina Faso révèle de nouveaux signes de résistance aux insecticides

L’une des principales découvertes d’une nouvelle étude est l’identification de nouvelles variantes dans les gènes associés à la résistance aux insecticides chez les moustiques anophèles, les principaux vecteurs du paludisme en Afrique de l’Ouest, et de nouveaux mécanismes potentiels de résistance, soulignant l’importance de la surveillance génomique. Des variations ont été observées dans les gènes du canal sodium voltage-dépendant (VGSC) et de l’acétylcholinestérase (ACE1), qui sont des cibles clés pour les insecticides utilisés dans les moustiquaires insecticides de longue durée (MILDA) et la pulvérisation intradomiciliaire à effet rémanent (IRS).

L’article a été rédigé par une équipe de chercheurs dirigée par le Dr Mahamadi Kientega, entomologiste médical à l’Institut de Recherche en Sciences de la Santé (IRSS) au Burkina Faso, et il a été publié dans Journal du paludisme.

Intitulée « Le séquençage du génome entier des principaux vecteurs du paludisme révèle l’évolution de nouvelles variantes de résistance aux insecticides dans une étude longitudinale au Burkina Faso », la publication est le résultat d’une étude collaborative de l’Institut de Recherche en Sciences de la Santé-IRSS (Institut de Recherche en Sciences de la Santé) à Bobo-Dioulasso, MalariaGEN Vector Observatory et Target Malaria. Entre 2012 et 2017, des échantillons de moustiques ont été collectés dans trois villages du Burkina Faso : Bana, Souroukoudinga et Pala.

Dans l’étude, des signaux de sélection positive ont été identifiés dans ces gènes, suggérant un rôle potentiel dans l’adaptation des moustiques aux outils de lutte anti-vectorielle. La résistance aux insecticides constitue une menace majeure pour le développement de solutions visant à éliminer le paludisme, car la résistance réduit l’efficacité de deux des principales mesures de lutte antivectorielle qui ont joué un rôle clé dans la réduction de l’incidence du paludisme dans les pays endémiques : les moustiquaires et la pulvérisation.

« Aujourd’hui plus que jamais, il est crucial de comprendre la génomique des moustiques pour surveiller et comprendre comment ce champion de l’évolution biologique continue d’échapper aux stratégies de contrôle vectoriel. En réponse à la forte couverture de moustiquaires insecticides, le comportement de piqûre des moustiques a changé à plusieurs niveaux. régions d’Afrique et nous devons commencer à envisager de nouveaux outils de lutte antivectorielle efficaces et durables », déclare le Dr Kientega, chercheur à l’Institut de Recherche en Sciences de la Santé (IRSS), Burkina Faso.

Le rôle central de la surveillance génomique

Les moustiquaires insecticides à longue durée d’action (MILDA) et la pulvérisation intradomiciliaire à effet rémanent (PID) sont la pierre angulaire des interventions actuelles contre le paludisme. En 2023, le Fonds mondial a distribué 227 millions de moustiquaires aux familles et couvert 7,9 millions de foyers par pulvérisation pour prévenir les cas de paludisme. À l’échelle mondiale, on estime que 2,1 milliards de cas de paludisme et 11,7 millions de décès dus au paludisme ont été évités au cours de la période 2000-2022, selon le Rapport mondial sur le paludisme.

Cependant, les progrès dans la réduction de la mortalité et de la morbidité dues au paludisme sont au point mort, et le monde est loin d’atteindre les objectifs de 2030 en matière de morbidité et de mortalité dues au paludisme. Le déploiement intensif d’outils de lutte contre les vecteurs du paludisme à base d’insecticides a été efficace, même s’il entraîne une évolution rapide de phénotypes résistants aux insecticides comme les organophosphorés ou les pyréthrinoïdes.

Cette étude collective sur la génomique des moustiques impliquant plusieurs partenaires de recherche souligne l’importance de la surveillance moléculaire des variantes existantes de résistance aux insecticides, des nouvelles variantes et de la compréhension des processus évolutifs sous-jacents à leur émergence.

« La détection de la résistance aux insecticides nous permettra d’adapter notre stratégie de lutte contre le paludisme, d’anticiper l’essoufflement des interventions conventionnelles de lutte anti-vectorielle et de promouvoir des alternatives durables et innovantes, telles que les moustiques génétiquement modifiés, les symbiotes naturels et les composés insecticides », ajoute Kientega.

Une meilleure compréhension de la dynamique des populations de vecteurs du paludisme

Dans le cadre du projet Anopheles gambiae 1000 génomes (Ag1000G), le génome des échantillons comprenait 1409 Anopheles gambiae sensu lato (sl). les moustiques (978 femelles et 431 mâles) ont été séquencés. Les résultats fournissent une analyse complète de la diversité génétique des espèces complexes d’Anopheles gambiae, avec un accent particulier sur An. gambiae ss, An. coluzzii et An. arabensis. Les résultats de l’étude révèlent des structures de population distinctes dans différentes régions, ce qui est important pour comprendre comment la résistance se propage et évolue géographiquement.

Anopheles coluzzii était l’espèce la plus prédominante trouvée dans les trois villages où les moustiques ont été collectés. Un. coluzzii représente 53 % des échantillons, suivi par An. gambiae ss avec 39%, tandis qu’An. arabiensis ne représentait que 8 % des échantillons collectés. Un. coluzzii reste l’espèce la plus prédominante à Bana (84%) et Souroukoudinga (61%) tandis qu’An. gambiae ss est répandu à Pala (71 %). Deux hybrides d’An. gambiae ss et An. coluzzii ont également été identifiés.

Analyses de la diversité génétique chez An. gambiae ss et An. coluzzii semble indiquer de faibles différenciations génétiques et un flux génétique continu, ce qui signifie que ces deux espèces sont strictement liées et s’accouplent souvent, les gènes circulant facilement entre les deux (y compris la résistance aux insecticides). Au contraire, An. arabiensis présentait une différenciation génétique plus élevée par rapport aux autres espèces, ce qui suggère un flux génétique limité.