Une étude révèle les signatures génétiques du carrefour culturel du pois chiche

La critique geante de licone de la SHL sur la

par Casey McGrath, SMBE Journals (Biologie moléculaire et évolution et Biologie et évolution du génome)

Avec sa saveur de noisette et son profil nutritif dense, l’humble pois chiche a captivé les palais et nourri les civilisations pendant des millénaires. De ses origines anciennes à son utilisation répandue dans les cuisines et les restaurants modernes du monde entier, cette légumineuse fait preuve à la fois de polyvalence culinaire et d’importance culturelle. Malgré l’importance des cuisines traditionnelles sur plusieurs continents, l’origine, la diversification et la propagation des pois chiches au Moyen-Orient, en Asie du Sud, en Éthiopie et en Méditerranée occidentale sont restées un mystère.

Une nouvelle étude en Biologie moléculaire et évolution intitulé « Itinéraires historiques pour la diversification du pois chiche domestiqué déduit de la génomique des races locales » met en lumière les effets profonds de la migration humaine et du commerce sur le patrimoine génétique du pois chiche.

L’étude – dirigée par Anna Igolkina de l’Université polytechnique Pierre le Grand de Saint-Pétersbourg, Eric von Wettberg de l’Université du Vermont et Sergey Nuzhdin de l’Université de Californie du Sud – a utilisé les données génétiques de plus de 400 spécimens de pois chiches collectés dans les années 1920 et 1930. . La collection comprenait à la fois les sous-types desi et kabuli, qui diffèrent par la couleur et la taille, malgré l’absence de frontière géographique ou génétique claire entre les deux.

Les échantillons de pois chiches provenaient de neuf régions géographiques différentes : le nord de la Méditerranée, le sud de la Méditerranée, la Turquie, le Liban, l’Éthiopie, la mer Noire, l’ouest de l’Ouzbékistan, l’est de l’Ouzbékistan et l’Inde. Pour analyser les données, les chercheurs ont développé deux nouveaux modèles, qu’ils ont nommés popdisp (populairerèglement afficherersals) et migadmi (migrations et admiluminaires).

Les auteurs ont utilisé le modèle popdisp pour comprendre comment les pois chiches se sont dispersés dans chacune des régions géographiques. Ils ont comparé deux scénarios, l’un dans lequel les pois chiches se propagent le long de routes plus faciles à traverser pour les humains (c’est-à-dire d’éventuelles routes commerciales historiques), et l’autre dans lequel les pois chiches se dispersent sur des distances de manière linéaire simple, quelles que soient les barrières géographiques intermédiaires.

Selon Igolkina, « Notre étude révèle une découverte intrigante concernant la parenté génétique entre les races locales de pois chiches dans différentes régions géographiques. Contrairement à l’hypothèse selon laquelle la similitude génétique serait déterminée par la distance linéaire, nos résultats suggèrent qu’elle est davantage influencée par les coûts de déplacement humain. Cela implique que la propagation du pois chiche dans chaque région s’est produite principalement le long des routes commerciales, plutôt que par simple diffusion. »

En utilisant le modèle migadmi, les scientifiques ont cherché à découvrir l’origine de la population desi éthiopienne. « Les pois chiches éthiopiens ont une saveur unique », déclare von Wettberg, « avec l’acidité des pois chiches noirs desi que l’on trouve dans les variétés indiennes, mais aussi un soupçon de douceur. »

Des études antérieures ont suggéré deux origines possibles pour les pois chiches éthiopiens – soit une origine indienne soutenue par des similitudes morphologiques, soit une origine moyen-orientale compte tenu des preuves de la migration humaine de l’ouest de l’Eurasie vers l’Afrique de l’Est il y a environ 4 500 ans. Fait intéressant, les résultats ont révélé que les deux scénarios peuvent être vrais, constatant que les pois chiches éthiopiens partagent l’ascendance des populations sources indiennes, libanaises et de la mer Noire.

von Wettberg note « Pour moi, la découverte la plus excitante est que les pois chiches éthiopiens sont un mélange d’ascendance moyen-orientale et sud-asiatique. Le lien culturel des Éthiopiens avec le Moyen-Orient est largement connu, illustré par leur héritage sémitique. Moins bien connu est le l’étendue et l’importance des routes commerciales de l’océan Indien, qui étaient à la fois une route maritime importante de la route de la soie et un moyen par lequel les échanges agricoles et culturels se produisaient entre l’Asie du Sud et l’Afrique de l’Est.

Le modèle migadmi a également révélé l’origine possible du type kabuli à partir d’une population locale de pois chiches desi en Turquie. Cela conteste la suggestion linguistique selon laquelle le type kabuli est apparu en Asie centrale et porte le nom de la ville de Kaboul (dans l’Afghanistan moderne).

Bien que ces résultats offrent un aperçu fascinant de l’histoire naturelle du pois chiche et de son interconnexion avec les routes commerciales et les migrations humaines, les implications de cette étude s’étendent bien au-delà des seuls pois chiches.

« L’importance de ce travail réside non seulement dans l’extension de nos connaissances sur l’histoire du pois chiche, mais également dans le développement des deux nouveaux modèles, popdisp et migadmi », note Igolkina. « Ces modèles peuvent être appliqués ensemble ou séparément pour analyser les migrations et les mélanges chez d’autres espèces. La technique de modélisation de base utilisée dans ces modèles, l’analyse des données de composition, permet leur extension pour modéliser des marqueurs génétiques multialléliques. Ceci est particulièrement intéressant lors de l’analyse de variantes structurelles. , dont les analyses deviennent de plus en plus courantes. »

von Wettberg est d’accord : « Une partie centrale de notre travail consiste à développer de nouveaux outils pour examiner les schémas de migration complexes. espèces naturelles. »

Plus d’information:
Anna A Igolkina et al, Itinéraires historiques pour la diversification du pois chiche domestiqué déduit de la génomique des races locales, Biologie moléculaire et évolution (2023). DOI : 10.1093/molbev/msad110

Fourni par SMBE Journals (Molecular Biology and Evolution et Genome Biology and Evolution)

ph-tech