La diversité du microbiote du sol est étroitement liée au cycle des nutriments et à la gestion durable des sols. Le système complexe du sol abrite une vaste gamme d’organismes du sol de différentes tailles corporelles et est un centre de régulation pour la majorité des fonctions de l’écosystème. Cependant, il manque encore une compréhension claire des processus d’assemblage de la communauté du sol au niveau de l’ensemble de la communauté, c’est-à-dire du gradient de taille des groupes de microbiote du sol.
Dans une étude publiée dans Écologie moléculaire, des chercheurs du Jardin botanique tropical de Xishuangbanna (XTBG) de l’Académie chinoise des sciences ont tenté d’identifier la relation entre la taille du corps et l’assemblage de la communauté du sol dans un écosystème forestier tropical saisonnier hyper diversifié situé dans la région de Xishuangbanna présentant une biodiversité élevée en Chine. Ils voulaient savoir si l’assemblage de la communauté multitrophique du microbiote du sol dans la forêt pluviale tropicale saisonnière avait tendance à être déterministe avec l’augmentation de la taille corporelle à l’échelle locale.
À l’aide d’un échantillonnage aléatoire stratifié systématique, les chercheurs ont prélevé 243 échantillons de sol et d’organismes sur une parcelle de 20 hectares dans la forêt tropicale humide du Xishuangbanna. Un total de 29 microbiotes du sol, y compris des archées, des bactéries, des champignons et des nématodes, ont été sélectionnés pour définir un gradient de taille corporelle, et neuf attributs végétaux et 17 variables environnementales ont été mesurés.
Ils ont ensuite effectué un séquençage à haut débit, une analyse des variations et les coordonnées principales des matrices de voisinage pour étudier la composition de la communauté du sol, la distribution spatiale et les processus d’assemblage en fonction de la taille des propagules (y compris les archées, les bactéries, les champignons et les nématodes).
Les résultats ont montré que dans la forêt pluviale tropicale saisonnière, l’assemblage du microbiote multitrophique du sol devenait de plus en plus déterministe avec l’augmentation de la taille corporelle. Les organismes du sol ont montré une similitude communautaire plus élevée que les grands organismes. Avec l’augmentation de la taille corporelle, la similitude de la communauté a diminué de manière significative.
Ils ont en outre découvert que les facteurs environnementaux et les attributs des plantes interviennent dans l’assemblage du microbiote multitrophique du sol. L’influence de l’habitat (propriétés du sol et variables topographiques) était plus importante pour les petits organismes qui montraient une tendance à la baisse avec l’augmentation de la taille corporelle. Les attributs des plantes, ainsi que l’habitat et les facteurs spatiaux, ont imposé des impacts négatifs le long du gradient de taille corporelle, ce qui suggère que les traits fonctionnels des plantes exercent une forte influence sur la structuration de l’habitat en modulant les propriétés du sol.
« Nos données suggèrent que l’assemblage des communautés multitrophiques du sol peut s’expliquer dans une certaine mesure par des changements dans les attributs des plantes au-dessus du sol. Cette étude fournit des preuves suggérant que le processus d’assemblage de la communauté a tendance à être plus déterministe avec l’augmentation de la taille corporelle », a déclaré Yang. Xiaodong de XTBG.
Wenting Wang et al, La taille du corps détermine l’assemblage de la communauté multitrophique du microbiote du sol associé aux attributs du sol et des plantes dans une forêt tropicale tropicale saisonnière, Écologie moléculaire (2022). DOI : 10.1111/mec.16585