Une équipe internationale termine le premier atlas cellulaire du corps entier d’un primate non humain

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Dans une percée qui pourrait conduire à des progrès scientifiques dans le traitement des maladies humaines, des chercheurs de BGI-Research, en collaboration avec des équipes de recherche scientifique de Chine, d’Allemagne, d’Italie, de Singapour, d’Espagne, de Suède et du Royaume-Uni, ont publié aujourd’hui le premier non- atlas transcriptomique des cellules du corps entier des primates humains dans la revue scientifique Nature.

En utilisant la plate-forme de bibliothèque unicellulaire DNBelab C4 développée indépendamment par BGI, les chercheurs de BGI, de l’Université de Jilin, des Instituts de biomédecine et de santé de Guangzhou (Académie chinoise des sciences) et de 32 autres institutions internationales ont terminé le transcriptome unicellulaire de 45 tissus et organes de singes macaques à longue queue (cynomolgus), obtenant un total de 1,14 million de données unicellulaires et identifiant 113 principaux types de cellules. L’étude a obtenu une autorisation éthique avant d’être menée.

Cette étude et d’autres recherches à grande échelle sur les primates au niveau de la cellule unique ne sont possibles que grâce aux développements de la technologie de séquençage avancée, un domaine où BGI est un leader. La technologie exclusive de BGI permet une analyse approfondie et multidimensionnelle d’une seule cellule avec une sensibilité et une précision élevées à un faible coût.

« La recherche sur les cellules uniques transforme notre compréhension des fonctions des tissus et des organes au niveau cellulaire, ce qui explique comment les maladies se développent et comment elles peuvent être traitées », a déclaré le Dr Liu Longqi de BGI-Research, l’un des auteurs correspondants de l’article. . « Avoir une carte unicellulaire d’un organe du corps entier du macaque adulte améliorera considérablement la capacité de déterminer comment développer des traitements potentiels pour les maladies humaines avec une plus grande précision. »

En cartographiant le transcriptome du macaque au niveau d’une seule cellule, les scientifiques disposent désormais d’une base de données, ou bibliothèque unicellulaire, qui peut être utilisée pour

  • développer des méthodes de diagnostic et de traitement des maladies humaines,
  • évaluation de l’efficacité clinique des médicaments,
  • analyse de l’évolution cellulaire parmi les espèces, et
  • analyse des fonctions cognitives avancées du cerveau.
  • « En comprenant les types de cellules et leurs caractéristiques, les scientifiques seront en mesure de prédire l’impact des traitements des maladies sur des structures cellulaires spécifiques et ainsi de développer des approches plus ciblées pour les maladies génétiques à gène unique ou complexes », a déclaré le co-auteur correspondant, le Dr Xu Xun, directeur de BGI-Recherche.

    La cartographie unicellulaire a permis à l’équipe d’identifier les types de cellules qui peuvent contribuer à la maladie humaine ou rendre les individus plus sensibles à la maladie. Par exemple, dans COVID-19, la plus grande manifestation est la pneumonie car le SRAS-CoV-2 infecte un petit groupe de cellules dans les poumons. Cependant, la cartographie unicellulaire du macaque a également identifié certaines cellules dans d’autres tissus qui peuvent être infectées. Cela peut aider les médecins à comprendre où rechercher des signes de COVID-19.

    La cartographie unicellulaire peut également aider à identifier les cellules qui métabolisent les calories provenant des graisses, permettant aux chercheurs de comprendre les contributeurs sous-jacents à l’obésité. De même, ce processus pourrait aider à identifier quelles cellules régulent les circuits neuronaux dans le cerveau, conduisant à des traitements potentiels pour les maladies neurologiques.

    « Cette étude comble le vide de la carte unicellulaire des primates non humains et constitue une riche source de données qui servira de référence très importante pour l’évolution future des espèces, la science du cerveau, l’évaluation et le dépistage des médicaments et les études de recherche préclinique », a déclaré un autre auteur co-correspondant, le Dr Miguel A. Esteban de l’Université de Jilin et des Instituts de biomédecine et de santé de Guangzhou (Académie chinoise des sciences).

    Plus d’information:
    Longqi Liu, Atlas transcriptomique cellulaire du primate non humain Macaca fascicularis, Nature (2022). DOI : 10.1038/s41586-022-04587-3. www.nature.com/articles/s41586-022-04587-3

    Fourni par le groupe BGI

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