Les protéines constituent les principaux éléments constitutifs de tous les organismes vivants. Ils sont souvent décrits comme les ouvriers de la cellule, où ils—ensemble ou individuellement—effectuent de nombreuses tâches essentielles. En cas de problème, les conséquences sont souvent graves. La recherche et les soins de santé ont exprimé le besoin d’outils efficaces pour analyser les fonctions et les activités des protéines, et dans un nouvel article dans une revue scientifique Communication Naturel’équipe du professeur Ola Söderberg présente MolBoolean, une technologie qui devrait ouvrir des portes importantes dans la recherche sur les cellules et le cancer.
« MolBoolean est une méthode pour déterminer les niveaux d’une paire de protéines dans des cellules individuelles, tout en identifiant en parallèle le pourcentage de ces protéines qui se lient les unes aux autres. Nous avons continué à développer un outil que nous avons créé en 2006, qui est aujourd’hui utilisé partout le monde, et les fonctions que nous ajoutons maintenant génèrent des informations sur les quantités relatives de différentes protéines ainsi que sur les quantités relatives de complexes protéiques, rendant ainsi l’état d’activité et la communication des cellules plus visibles », déclare Ola Söderberg, professeur de recherche pharmaceutique sur les cellules Biologie à l’Université d’Uppsala. « Cela peut être comparé à l’évaluation d’un restaurant ; 10 avis positifs donnent une certaine information, mais il est important de savoir s’ils sont basés sur dix ou 1 000 avis. »
Les résultats du groupe suscitent un grand intérêt dans les milieux universitaires et industriels, et actuellement la société Atlas Antibodies, basée à Stockholm, qui a récemment dépassé le brevet de MolBoolean, prépare la méthode pour le marché. L’outil devrait être d’une grande valeur dans la recherche et, à long terme, également dans les soins de santé pour améliorer le diagnostic et le choix du traitement du cancer.
« Notre recherche vise à développer des outils pour visualiser les processus au sein des cellules et à augmenter, par exemple, la connaissance de ce qui se passe dans les cellules cancéreuses. Connaître l’équilibre entre les protéines libres et en interaction est important lors de l’étude de la signalisation cellulaire, et nous pensons que MolBoolean sera apprécié dans de nombreux laboratoires de recherche », déclare Doroteya Raykova, chercheuse au Département des biosciences pharmaceutiques et première auteure de l’article.
MolBoolean est développé par le groupe d’Ola Söderberg à la faculté de pharmacie de l’Université d’Uppsala. Les travaux ont été menés en collaboration avec des chercheurs des universités de Porto et d’Uppsala, SciLifeLab et Atlas Antibodies.
Doroteya Raykova et al, Une méthode d’analyse booléenne des interactions protéiques au niveau moléculaire, Communication Nature (2022). DOI : 10.1038/s41467-022-32395-w