Au 21e siècle, la « collaboration » est devenue un mot à la mode populaire, mais travailler efficacement ensemble à travers les disciplines et les pays est plus facile à dire qu’à faire. Cependant, une collaboration authentique est essentielle dans la lutte contre les phytopathogènes ; le partage d’informations sur les maladies des plantes facilite la détection précoce, la caractérisation efficace et rapide et la gestion ultérieure.
Physostegia chlorotic mottle virus (PhCMoV), une maladie des plantes identifiée pour la première fois en Autriche en 2018, a initialement reçu une caractérisation inadéquate. Cela a ensuite déclenché des études à travers l’Europe alors que de nouveaux symptômes apparaissaient sur des cultures économiquement importantes. Ces études indépendantes ont convergé en une seule étude, publiée dans Maladie des plantesdémontrant la puissance de la collaboration au-delà d’un simple mot à la mode.
Dans l’étude coalescente, Coline Temple et ses collègues de huit laboratoires de cinq pays européens ont utilisé le partage de prépublication de données de séquençage à haut débit (HTS) pour améliorer les connaissances sur la biologie, l’épidémiologie et la diversité génétique du PhCMoV.
Les chercheurs ont identifié PhCMoV dans huit pays européens, en plus de l’Autriche, et ont confirmé sa présence dans des échantillons collectés en 2002. L’inoculation mécanique de PhCMOV à des plantes hôtes saines dans des conditions témoins a permis aux auteurs de valider l’association du virus avec des symptômes. Leurs résultats montrent que le PhCMoV peut infecter au moins neuf espèces végétales et provoquer de graves symptômes de fruits sur des cultures économiquement importantes telles que la tomate, l’aubergine et le concombre.
De plus, le séquençage de 21 plantes hôtes infectées différentes d’origines diverses a permis de comparer les génomes, ce qui a montré que les génomes de deux isolats du même site ont à peine évolué sur 17 ans. Cela suggère que le même isolat du micro-organisme peut survivre sans adaptation dans un écosystème spécifique.
En plus de caractériser une maladie émergente des plantes, cette étude illustre comment la solidarité et la confiance entre scientifiques peuvent accélérer un objectif commun. L’auteur correspondant, Sébastien Massart, rappelle le processus en commentant : « Le moment le plus excitant de cette recherche a été lorsque nous avons progressivement réalisé que nous n’étions pas seuls, que différents groupes de recherche avaient soudainement et indépendamment détecté ce virus dans différentes plantes hôtes symptomatiques et dans des pays de toute l’Europe. . »
S’unir contre ce virus en partageant la prépublication des données HTS a créé un espace collaboratif sans concurrence, qui montre comment « faire confiance à ses collègues et partager des informations sur les résultats les plus récents entre les groupes peut faciliter la synergie, accélérer la caractérisation du virus et rassembler le plus d’informations dans une seule publication « , dit Massart.
Ces recherches bénéficieront à terme à tous les acteurs de la santé des plantes et offriront une base solide de connaissances pour de futures études sur les rhabdovirus végétaux.
Plus d’information:
Coline Temple et al, Caractérisation biologique et génétique du virus de la marbrure chlorotique de Physostegia en Europe en fonction de la gamme d’hôtes, de l’emplacement et de l’heure, Maladie des plantes (2022). DOI : 10.1094/PDIS-12-21-2800-RE
Fourni par la société américaine de phytopathologie