La plus grande collection d’échantillons d’oiseaux sauvages d’Australie a été établie par des experts de tout le pays, dont un chercheur de l’Université Deakin. Voici ce qu’il montre sur les maladies zoonotiques.
La pandémie de COVID-19 est la maladie zoonotique la plus récente, celle causée par des germes qui se propagent des animaux aux humains. Mais les épidémies de monkeypox et d’encéphalite japonaise signifient que se tenir au courant du trafic de virus n’a jamais été aussi important.
Les experts disent que ce n’est qu’une question de temps avant qu’une épidémie d’un autre nouveau virus infectieux ne frappe. Les nouveaux virus qui combinent la grippe humaine et la grippe aviaire sont des candidats de choix pour la prochaine pandémie.
La grippe aviaire cause des problèmes dans le monde et en Australie. Rien qu’en 2020, près d’un demi-million d’oiseaux victoriens ont été abattus après plusieurs épidémies impliquant trois souches du virus. Bien que les virus de la grippe aviaire s’attachent généralement à infecter les oiseaux, ils font parfois le saut potentiellement mortel vers d’autres animaux, y compris les humains.
Heureusement, des recherches sur l’analyse des facteurs de risque pour de tels scénarios sont déjà en cours au Centre d’écologie intégrative (CIE) de l’Université Deakin.
« Historiquement, toutes les grandes pandémies liées à la grippe ont eu une composante virale de la grippe aviaire. Le potentiel de propagation d’un agent pathogène des oiseaux sauvages dans les élevages de volailles et dans le monde est important pour la santé publique. Mon travail vise à surveiller ce qui se passe dans oiseaux pour nous tenir informés et minimiser nos risques », déclare le professeur Alfred Deakin Marcel Klaassen du CIE.
Le professeur Klaassen a constitué la plus grande collection d’échantillons d’oiseaux sauvages du pays. La collecte d’échantillons en combinaison avec ceux d’un réseau de chercheurs à travers l’Australie est cruciale pour en savoir plus sur l’évolution de la grippe aviaire et la façon dont elle se propage.
Au cours des 12 dernières années, le professeur Klaassen a échantillonné à lui seul plus de 15 000 oiseaux sauvages, y compris des oiseaux de rivage, pour comprendre non seulement où les virus circulent, mais aussi leurs origines internationales.
« Notre recherche demande effectivement : quel est le potentiel de ces oiseaux migrateurs à nous apporter de méchants virus d’autres continents ? »
Alors que de nouveaux types de virus continuent de circuler dans le monde, le professeur Klaassen explique pourquoi il est si crucial de se faire vacciner chaque année contre la grippe.
« Les vaccins contre la grippe ne nous protègent que pendant un temps limité, non pas parce qu’ils cessent de fonctionner, mais parce que le virus lui-même change. Chaque année, notre système immunitaire doit être mis à jour avec des anticorps pour lutter contre les nouveaux virus émergents. »
Les chercheurs ont également analysé les échantillons d’anticorps pour détecter si un oiseau sauvage a été infecté par la grippe aviaire, ainsi que la souche qu’il avait, pour approfondir les données.
« Nos découvertes montrent que les oiseaux migrateurs qui viennent en Australie sont parfois infectés par de méchants virus, mais ils ne l’ont pas encore amené sur nos côtes.
« La façon dont le [bird flu] les virus évoluent dans l’hémisphère nord, il est probable que nous connaîtrons également davantage d’épidémies de grippe aviaire », déclare le professeur Klaassen.
Après avoir découvert que l’épidémiologie de la grippe aviaire chez les oiseaux sauvages australiens est liée aux précipitations, le professeur Klaassen étudie également ce que cela signifie pour l’industrie avicole. Il utilise l’apprentissage automatique et l’imagerie satellite de l’eau dans le paysage pour identifier les périodes où les agriculteurs doivent être plus vigilants. Ses dernières recherches sont publiées dans Pathogènes PLOS.
Il reste à voir si les virus de la grippe aviaire pourraient conduire à la prochaine pandémie, mais les chercheurs sont au courant des souches émergentes dans les populations d’oiseaux si le pire devait arriver.
« Cette recherche nous aide à approfondir nos connaissances sur la façon dont ce virus se propage dans la faune, le bétail et, finalement, les humains. Elle offre des preuves de la manière dont nous pouvons répondre de manière réfléchie aux futures épidémies. »
Michelle Wille et al, Australie en tant que puits mondial pour la diversité génétique du virus de la grippe aviaire A, Pathogènes PLOS (2022). DOI : 10.1371/journal.ppat.1010150
Marta Ferenczi et al, Flambées de virus de la grippe aviaire causées par les précipitations et par les oiseaux sauvages chez les volailles australiennes, Recherche vétérinaire BMC (2021). DOI : 10.1186/s12917-021-03010-9
Michelle Wille et al, Preuve sérologique de l’exposition aux virus hautement pathogènes de la grippe aviaire H5 chez les oiseaux de rivage migrateurs, Australie, Maladies infectieuses émergentes (2019). DOI : 10.3201/eid2510.190699