Granges poussiéreuses, écuries rutilantes et sous-sols humides. Ce sont tous des endroits où vous pourriez trouver une souris domestique ou un membre de mon équipe de recherche.
je suis un biologiste évolutionniste, et mon laboratoire de l’Université Drexel étudie les souris domestiques sauvages. Avec l’aide des résidents de Philadelphie, nous collectons des souris dans des immeubles de grande hauteur et des maisons en rangée pour en savoir plus sur les impacts de la vie en ville sur les souris domestiques. En bref, nous voulons savoir s’il existe une base scientifique pour Fable « La souris des villes et la souris des champs » dans lequel les cousins mangent différemment selon l’endroit où ils habitent.
Les villes sont plus chaudes et ils ont beaucoup de gens vivant dans des densités élevées, ce qui signifie plus de déchets et généralement plus de pollution. Cela peut affecter la façon dont les espèces qui vivent dans les villes évoluent. Les villes sont également dominées par des habitats artificiels tels que des trottoirs, des gratte-ciel et des métros plutôt que par des champs ouverts et des forêts.
Nous nous intéressons à de nombreux changements possibles, mais surtout à savoir si les nombreuses différences entre les environnements urbains et ruraux se traduisent par des différences génétiques entre les souris des villes et celles des campagnes, par exemple quelles versions des gènes liés au métabolisme sont les plus courantes.
Pour trouver les réponses, nous séquençons le génome des souris. Grâce à ces données, nous pouvons répondre à diverses questions, telles que : les souris des villes sont-elles plus ou moins diversifiées génétiquement que les souris des campagnes ? Existe-t-il des régions de l’ADN, la molécule qui code l’information génétique, qui sont systématiquement différentes entre les souris urbaines et rurales ? Si oui, quelles sont les fonctions des gènes dans ces régions ?
Pourquoi étudier les souris domestiques ?
L’une des raisons pour lesquelles nous étudions les souris domestiques est qu’elles sont très répandues. Colonisateurs européens a amené des souris domestiques en Amérique il y a environ 500 ans. Les rongeurs se sont désormais répandus dans de nombreux climats et habitats différents en Amérique du Nord et du Sud, dans la plupart des endroits où vivent les humains, y compris Philadelphie.
Bien que de petite taille, les souris domestiques ont créé d’immenses contributions à la génétique et à la médecine. Ce sont des mammifères comme les humains, mais les souris domestiques se reproduisent rapidement et sont relativement faciles à reproduire et à entretenir. En fait, si les scientifiques ont adopté très tôt les souris comme système modèle, c’est en partie parce que les gens se reproduisaient déjà. »souris fantaisie » comme animaux de compagnie. En conséquence, les méthodes pour les garder et les élever étaient connues.
Les souris présentent de nombreux traits visibles que les généticiens doivent étudier. Mon équipe souhaite en savoir plus sur les gènes et les traits qui ont contribué à leur capacité à prospérer dans divers environnements. Le travail que nous effectuons avec les souris domestiques sauvages se répercute également sur le travail avec les souris de laboratoire et la recherche biomédicale.
Les souris domestiques trouvées dans les greniers et les armoires sont les mêmes espèces que celles étudiées en laboratoire, mais elles sont plus diversifié génétiquement que les souches de laboratoire. Notre projet générera des séquences complètes du génome de nombreuses souris sauvages, et ces données pourront aider les scientifiques qui étudient les traits et les maladies.
Conseils pour attraper des souris
J’ai déjà travaillé sur un grand projet en étudiant comment les souris domestiques se sont adaptées à différents climats dans les Amériques. Pour ce projet, je suis allé dans de très nombreuses fermes dans tout l’est des États-Unis et je suis devenu très doué pour attraper des souris dans les granges.
Démarrer ce projet en mettant l’accent sur les villes était un nouveau défi. Tout d’abord, notre équipe a dû trouver des résidents de Philadelphie qui voulaient que nous piégions leurs souris. Nous avons passé beaucoup de temps à faire passer le message sur les réseaux sociaux, à parler à des amis et à publier des dépliants.
Nous avons parlé à de nombreux Philadelphiens frustrés de vouloir débarrasser leur maison des souris. Certains avaient des vidéos de souris domestiques évitant les pièges qu’elles avaient tendus ou volant l’appât et s’enfuyant. Nous partageons cette frustration et la ressentons vivement. Dans certains cas, il nous a fallu plusieurs jours pour attraper une seule souris dans un appartement.
Cela s’explique en partie par le fait que de nombreuses maisons de Philadelphie sont vieilles. Cela signifie qu’ils sont souvent pleins de caractère et qu’ils ont des trous qui offrent aux souris d’excellents endroits où se cacher. Il est difficile d’attirer les souris hors de leurs nids et dans nos pièges. Nous avons eu le plus de succès avec l’appât au beurre de cacahuète, qui dégage une odeur forte et très attrayante pour les souris. Mais les souris sont omnivores et ont un régime alimentaire diversifié comprenant des insectes. Nous avons entendu de nombreuses histoires de membres de la communauté qui utilisaient des appâts tels que du chocolat, des céréales, des biscuits et même des morceaux de bacon.
Et après
Nous espérons commencer à partager les résultats au cours des deux prochaines années. Nous travaillons dans trois villes – Philadelphie, New York et Richmond, Virginie – et avons réalisé nos premières collections. Nous devons maintenant générer et analyser des données génétiques, nous sommes donc très occupés en laboratoire.
Nous extrayons l’ADN, ainsi qu’une autre forme de matériel génétique appelé ARN, de différents tissus. Grâce à l’ADN, nous étudierons l’ampleur de la variation génétique au sein des populations de souris urbaines et s’il existe des différences génétiques entre les souris urbaines et rurales. L’ARN nous aidera à comprendre comment les différences dans l’ADN se traduisent par des différences dans le métabolisme, la physiologie et d’autres processus cellulaires.
Nous verrons également s’il existe des différences dans les traits. Par exemple, nous mesurerons leurs crânes et leurs squelettes. Nous séquencerons l’ADN des microbes dans leur système digestif pour en savoir plus sur leurs microbiomes intestinaux, l’ensemble des bactéries qui vivent dans leur système digestif et utiliserons analyse des isotopes stables pour identifier les différences dans leur alimentation. L’analyse des isotopes stables de l’alimentation utilise les ratios d’atomes naturels d’éléments tels que le carbone et l’azote pour déterminer les types d’aliments qu’un organisme a consommés.
Les villes regorgent d’animaux sauvages. Apprendre comment les villes façonnent l’évolution des souris peut nous aider à trouver de meilleures façons de gérer les populations de souris et d’autres espèces sauvages urbaines tout en mieux comprenant l’évolution.
Cet article est republié à partir de La conversation sous licence Creative Commons. Lis le article original.