La résistance aux antimicrobiens des bactéries intestinales est constamment détectée dans les élevages de volailles et dans les produits de vente au détail de volaille dans le monde entier, y compris dans les troupeaux de dindes. En ce qui concerne la surveillance, les informations et les études sur les associations entre la résistance aux antimicrobiens et l’utilisation des antimicrobiens chez les dindes ont été rares au cours de la dernière décennie. Dans une nouvelle étude, des chercheurs de toute l’Amérique du Nord ont modélisé l’impact de l’utilisation d’antimicrobiens sur l’émergence de la résistance aux antimicrobiens chez Escherichia coli isolé de troupeaux de dindons canadiens.
La résistance aux antimicrobiens a longtemps été identifiée comme une menace pour la santé mondiale, avec des options de traitement limitées chez les animaux et les humains. Bien que les antimicrobiens aident à traiter et à contrôler les infections bactériennes dans les troupeaux de volailles, ils entraînent également une résistance accrue car les bactéries survivantes transmettent leurs gènes de résistance non seulement à leur progéniture mais également à d’autres espèces bactériennes. De plus, ces bactéries peuvent également être transmises à l’homme par la consommation d’aliments contaminés ou par contact avec des volailles infectées.
Csaba Varga (IGOH), professeur adjoint d’épidémiologie, et son groupe de recherche ont utilisé des données recueillies par le Programme intégré canadien de surveillance de la résistance aux antimicrobiens. De 2016 à 2019, des vétérinaires de chaque province du Canada ont visité des élevages de dindons chaque année pour recueillir des données sur l’utilisation des antimicrobiens et obtenir des échantillons fécaux de troupeaux choisis au hasard.
« La plupart des chercheurs travaillent sur la volaille, en particulier les poulets. Peu de chercheurs travaillent sur les dindes », a déclaré Rima Shrestha, associée de recherche postdoctorale au laboratoire Varga. « Au Canada, ils ont une surveillance intégrative, qui nous fournit des données sur l’utilisation et la résistance aux antimicrobiens. »
Les chercheurs ont utilisé E. coli comme indicateur de la résistance aux antimicrobiens car ces bactéries font partie de la flore intestinale chez l’homme et l’animal. Ils peuvent également être facilement détectés dans des échantillons fécaux et environnementaux. « E. coli peut héberger des gènes de résistance aux antibiotiques qu’ils peuvent conserver et transmettre à d’autres bactéries dans l’intestin, ce qui en fait de bons indicateurs de l’utilisation des antimicrobiens », a déclaré Varga. Les isolats d’E. coli provenant d’échantillons fécaux de dindes ont été testés pour leur sensibilité à 14 antimicrobiens différents.
Pour étudier l’association entre l’utilisation d’antimicrobiens et la résistance, les chercheurs ont utilisé de nouvelles techniques de modélisation qui ont pris en compte les indications de la maladie pour l’utilisation d’antimicrobiens, la quantité d’antimicrobiens utilisée, la durée du traitement, le poids des oiseaux et la voie d’administration.
« Notre étude montre que l’utilisation d’antimicrobiens dans les aliments pour animaux est le principal moteur de la résistance », a déclaré Varga. « De plus, des antimicrobiens ont également été injectés dans les œufs du couvoir, ce qui a produit une résistance chez E. coli. » Les chercheurs ont également découvert que le traitement de certaines maladies, notamment les infections intestinales et les infections sanguines causées par E. coli, contribuait au développement de la résistance aux antimicrobiens.
« Nous travaillons actuellement sur l’examen de la résistance aux antimicrobiens chez d’autres agents pathogènes, notamment Salmonella et Campylobacter », a déclaré Shrestha. « Nous voulons également examiner les données des États-Unis afin de pouvoir les comparer aux données canadiennes et comprendre comment atténuer la résistance antimicrobienne. une ferme. »
L’étude a été publiée dans Frontières en microbiologie.
Rima D. Shrestha et al, Associations entre la résistance aux antimicrobiens dans les isolats fécaux d’Escherichia coli et l’utilisation d’antimicrobiens dans les troupeaux de dindons canadiens, Frontières en microbiologie (2022). DOI : 10.3389/fmicb.2022.954123