L’institut indien CSIR de génomique et de biologie intégrative, un institut de recherche du Conseil de la recherche scientifique et industrielle, s’est associé à Lenovo pour accélérer la recherche sur le cancer grâce à une infrastructure d’analyse génomique à hautes performances.
Dans le cadre de leur partenariat, le CSIR-IGIB utilisera l’outil Lenovo Genomics Optimization and Scalability Tool (GOAST) avec des processeurs Intel Xeon Scalable de deuxième génération pour permettre des charges de travail de séquençage du génome en profondeur. Selon Lenovo, GOAST utilise une architecture optimisée et un logiciel open source pour offrir « des performances de niveau GPU à des coûts de niveau CPU ».
L’Institut a mis en place un système à 28 nœuds, ce qui en fait le plus grand site pour GOAST en Inde et en Asie-Pacifique à ce jour.
POURQUOI EST-CE IMPORTANT
Le CSIR-IGIB est impliqué dans la recherche en génétique humaine visant à identifier les troubles génétiques, à caractériser les mutations qui entraînent la progression du cancer et à suivre les épidémies. Dans le séquençage génétique, la vitesse et l’échelle de calcul sont importantes, a déclaré l’ancien directeur, le Dr. Anurag Agrawal.
L’objectif de l’institut est d’aider ses chercheurs à analyser plus d’échantillons plus rapidement en utilisant une technologie performante.
Depuis qu’il utilise Lenovo GOAST, le CSIR-IGIB a constaté un « impact significatif sur les performances » pour le séquençage du génome entier (WGS) et le séquençage de l’exome entier (WES). « Dans les cycles de latence – où toutes les ressources d’un nœud sont dédiées à l’exécution d’un seul travail – l’institut peut terminer un flux de travail WGS et WES typique 6,5 fois plus rapidement », a-t-il expliqué.
« Le débit et la capacité de calcul plus élevés de Lenovo GOAST contribuent à accélérer le rythme de la recherche et à améliorer nos performances, entraînant des avancées scientifiques qui ont un impact réel sur la santé et la vie des gens », a commenté le Dr . grawal.
De plus, le maintien d’un rythme de recherche plus rapide permettra au CSIR-IGIB d’alimenter davantage de travaux scientifiques, de faire progresser les percées dans la compréhension de maladies comme le cancer et de trouver de meilleurs traitements qui améliorent les résultats pour les patients et sauvent des vies.
LA GRANDE TENDANCE
L’Inde rejoint le nombre croissant de pays d’Asie-Pacifique qui ont élargi leur paysage génomique et promu la médecine de précision.
En Australie, c’est Le Garvan Institute of Medical Research s’est récemment associé à Google Cloud pour un projet de traitement du génome à grande échelle afin de faire progresser la détection précoce de maladies génétiques rares.
celui de Singapour Precision Health Research est également impliquée dans une vaste étude de population sur les maladies spécifiques à l’Asie avec la société de technologie génomique Illumina. Ensemble, ils séquenceront et analyseront les génomes d’environ 100 000 participants consentants, en tirant parti des capacités de séquençage du génome à grande échelle d’Illumina. Une autre organisation singapourienne, le National Cancer Center Singapore, fait partie d’un partenariat national visant à créer une base de données génomique clinique locale pour générer des informations qui conduisent à de meilleurs résultats pour les patients atteints de cancer.
L’institut CSIR de génomique et de biologie intégrative de l’Inde adopte la solution d’analyse du génome de Lenovo est apparu en premier sur Germanic News.