Des chercheurs du CSIRO, l’agence scientifique nationale australienne, ont séquencé le premier génome du perroquet nocturne, l’un des oiseaux les plus rares et les plus insaisissables au monde. Le développement répondra à des questions sur la génétique et la biologie des populations qui pourraient renforcer les espoirs de conservation des espèces récemment redécouvertes.
« Le génome nous permettra d’explorer les bases génétiques qui expliquent pourquoi le perroquet nocturne est nocturne, une caractéristique très inhabituelle chez les perroquets. Nous étudierons des facultés telles que la navigation, l’odorat, la forme du bec et sa vision nocturne loin d’être optimale », a déclaré Dr Leo Joseph, directeur de la Australian National Wildlife Collection du CSIRO.
« Les chercheurs pourront également effectuer des analyses statistiques sur le génome de cet individu pour estimer la taille passée des populations de perroquets nocturnes en Australie. Nous avons désormais la possibilité de comparer ce génome annoté avec d’autres perroquets étroitement apparentés, mettant ainsi en lumière les raisons. derrière sa rareté et sa distribution limitée par rapport à beaucoup de ses parents.
Les chercheurs du CSIRO ont séquencé le génome du perroquet nocturne (son modèle génétique) à l’aide de tissus obtenus auprès du Dr Kenny Travouillon, conservateur par intérim de l’ornithologie au Western Australian Museum, après que les propriétaires traditionnels du Pilbara ont trouvé le spécimen décédé et l’ont livré au musée Boola Bardip.
Le spécimen, qui est le mieux conservé exposé au monde, est désormais ouvert au public au WA Museum Boola Bardip.
Le Dr Gunjun Pandey, qui a dirigé le projet de génomique des perroquets nocturnes, a déclaré que l’accès à la technologie de séquençage de l’ADN à haut débit dans le cadre de l’Initiative de génomique appliquée du CSIRO accélère la recherche en génomique en Australie.
« Nous pouvons désormais générer des génomes de très haute qualité à partir de très petits échantillons de tissus, même aussi petits qu’une tête de fourmi ou un seul moustique », a déclaré le Dr Pandey. « Ce niveau de qualité et de détail n’était tout simplement pas possible il y a cinq ans. Les données génétiques peuvent être utilisées pour garantir que les programmes de conservation maximisent la diversité, afin que l’espèce soit résiliente et ait les meilleures chances de survie à long terme. »
Autrefois répandu dans les régions arides d’Australie, le perroquet nocturne a décliné en raison de changements environnementaux tels que la prédation par les chats et les renards. Il n’est désormais connu que dans des parties localisées du sud-ouest du Queensland et de l’Australie occidentale.
« Quelques dizaines de spécimens scientifiques ont été collectés au cours du XIXe siècle et un en 1912. Puis un spécimen a été trouvé en 1990 dans le sud-ouest du Queensland », a déclaré le Dr Joseph. « Des oiseaux vivants ont été signalés dans la même zone en 2013, et un perroquet vivant a finalement été capturé et étiqueté en 2015. »
Si le génome du perroquet nocturne constitue une ressource scientifique passionnante pour mieux comprendre cet oiseau, la protection de l’espèce contre les chats, les renards, les incendies et la perte d’habitat est également cruciale pour leur conservation.
« Le génome du perroquet nocturne ouvrira de nombreuses opportunités pour des recherches plus approfondies afin de contribuer à la conservation de cette espèce », a déclaré le Dr Pandey. « Cela permettra aux scientifiques d’élaborer un plan pour sauver le perroquet nocturne, ce qui est le but ultime du séquençage du génome et de sa mise à la disposition du public. »
Plus d’information:
Le génome annoté est maintenant disponible en ligne dans le cadre de la base de données NCBI Reference Sequence (RefSeq) via les ensembles de données NCBI.