Selon une étude, le rôle de l’alimentation dans les chaînes de transmission de Clostridioides difficile doit encore être clarifié.
L’infection à Clostridioides difficile (ICD) est une cause notable de diarrhée infectieuse dans le monde.
La transmission interhumaine joue un rôle majeur, mais d’autres sources et voies d’infection sont à l’étude. Clostridioides difficile a été isolé dans divers aliments et les experts pensent qu’il est possible que certains d’entre eux soient des vecteurs importants pour sa large diffusion.
Les preuves existantes suggèrent que les pommes de terre, qui sont un aliment de base consommé dans le monde entier, peuvent contribuer à la propagation de Clostridioides difficile. Ils présentent les taux de contamination les plus élevés parmi les légumes testés à ce jour. Des cas confirmés d’ICD d’origine alimentaire n’ont pas été décrits à ce jour.
COMBACTE-CDI (Combatting Bacterial Resistance in Europe) est un consortium européen d’experts issus de huit organismes académiques et de recherche et de six partenaires industriels.
Une partie du travail consiste à fournir des informations actualisées sur Clostridioides difficile dans les aliments à travers l’Europe. Pour ce faire, le consortium a collecté des échantillons cliniques, animaux et alimentaires dans 12 pays. Les résultats ont été publiés dans la revue Eurosurveillance.
Entre janvier et juillet 2018, des pommes de terre de Pologne, de Roumanie, de Slovaquie, d’Autriche, de France, des Pays-Bas, du Royaume-Uni, d’Irlande, de Suède, de Grèce, d’Italie et d’Espagne ont été échantillonnées. Le nombre d’échantillons dans chaque pays variait de six en Irlande à 29 aux États-Unis et au Royaume-Uni et ils ont été collectés auprès de cinq à 20 détaillants par pays.
Rôle des pommes de terre positives dans les infections
Au total, 33 échantillons sur 147 ont été testés positifs pour Clostridioides difficile. Les neuf échantillons de Slovaquie étaient négatifs et les sept de Roumanie étaient positifs. Les taux de positivité entre les pays variaient considérablement.
Seuls 13 échantillons de pommes de terre ont été importés, la plupart d’autres pays de l’UE, mais un des États-Unis, un d’Israël et un d’Égypte.
Il y avait une différence significative dans la proportion d’échantillons positifs pour Clostridioides difficile entre les pommes de terre visiblement propres et celles modérément ou excessivement recouvertes de terre, ces dernières étant les plus contaminées.
Des taux élevés de contamination de la pomme de terre pourraient avoir des implications potentielles pour la santé publique, ont déclaré les chercheurs. Ils ont ajouté que des échantillons de très grande taille sont nécessaires pour comprendre l’étendue et la pertinence de Clostridioides difficile dans les aliments.
Les pommes de terre sont généralement lavées, épluchées et bouillies avant d’être consommées, ce qui réduit le risque qu’elles puissent être une source directe d’infection. Cependant, ils peuvent servir de vecteur pour l’introduction de spores de Clostridioides difficile dans l’environnement domestique et/ou la chaîne alimentaire où ils pourraient survivre.
Les ribotypes PCR prédominants détectés dans l’étude chevauchent les types de Clostridioides difficile trouvés chez les humains, les animaux et le sol.
« Les pommes de terre pourraient servir de transporteurs de spores qui se propagent entre les pays et contaminent l’environnement domestique. Une telle exposition constante combinée à un microbiote intestinal altéré de manière transitoire (résistance altérée à la colonisation) peut alors contribuer à l’apparition de l’ICD », ont déclaré les chercheurs.
Distribution chez l’homme et le porc
D’autres recherches, présentées lors de la réunion annuelle du Congrès européen sur la microbiologie clinique et les maladies infectieuses (ECCMID) à Lisbonne, ont fourni des preuves de la transmission de Clostridioides difficile entre les animaux et les humains.
« Notre découverte de gènes de résistance multiples et partagés indique que Clostridioides difficile est un réservoir de gènes de résistance aux antimicrobiens qui peuvent être partagés entre les animaux et les humains. La surutilisation des antibiotiques en médecine humaine et comme intrants bon marché dans les fermes érode notre capacité à guérir les infections bactériennes », a déclaré Semeh Bejaoui.
Bejaoui et ses collègues de l’Université de Copenhague et du Statens Serum Institut ont examiné des échantillons de Clostridioides difficile provenant de 14 élevages porcins au Danemark et des isolats cliniques de patients hospitalisés.
Le séquençage du génome a comparé les isolats d’échantillons de porc à ceux collectés en 2020 et 2021 chez des patients infectés par Clostridioides difficile. Sur 514 échantillons de porc, 54 présentaient des signes de Clostridioides difficile. Treize types de séquences trouvés chez les animaux correspondaient à ceux trouvés dans les échantillons de selles des patients.
Les auteurs ont noté plusieurs limites du travail encore non publié, y compris la direction de transmission peu claire.
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