Lorsqu’il s’agit des impératifs biologiques de survie et de reproduction, la nature trouve souvent un moyen, parfois plus d’un moyen. Pour une espèce de moucherolle des îles Salomon isolées, les scientifiques ont jusqu’à présent trouvé au moins deux voies génétiques conduisant au même résultat physique : des plumes entièrement noires. Ce changement n’était pas un hasard. C’était le résultat de la nature qui sélectionnait spécifiquement ce trait.
La nouvelle étude des chercheurs est publiée dans la revue Génétique PLOS. « Le Moucherolle à ventre marron n’est pas aussi connu que les pinsons de Darwin », a déclaré l’auteur principal Leonardo Campagna, généticien évolutionniste au Cornell Lab of Ornithology. « Mais ce complexe d’oiseaux a également subi de nombreux changements évolutifs, dont beaucoup impliquent des changements dans la coloration et la structuration de leur plumage. »
Le scénario : Une importante population d’oiseaux à ventre marron vit sur l’une des plus grandes îles de la chaîne du Pacifique. De là, certains oiseaux ont établi de nouvelles populations sur quelques petites îles. Au fil du temps, les oiseaux des deux petites îles ont perdu leur ventre marron et sont devenus tout noirs. Mais les oiseaux de chaque île ont développé un plumage noir à des moments différents, à partir de différentes mutations génétiques qui se sont propagées rapidement à travers les petites populations insulaires.
L’une de ces mutations s’est propagée au cours des 1 000 dernières années – un simple clin d’œil dans le temps de l’évolution. « Il y a clairement quelque chose d’avantageux à avoir un plumage entièrement noir », a déclaré Campagna. « Nous avons retracé ce trait dans le temps en séquençant pour la première fois l’intégralité du génome du Moucherolle à ventre roux. Les deux mutations qui conduisent au plumage noir sont apparues à des moments différents, sur différentes îles et sur différents gènes liés à la production de pigment de mélanine. . Ce niveau de convergence est fou. »
Les différentes populations de moucherolles en sont aux premiers stades de la spéciation – se séparant pour former de nouvelles espèces – mais elles n’ont pas encore beaucoup divergé génétiquement et elles peuvent se croiser. Mais ils le font rarement, produisant quelques hybrides. Des expériences sur le terrain ont montré que les oiseaux à ventre marron et les oiseaux entièrement noirs réagissent chacun de manière agressive envers un intrus perçu avec leur propre couleur de plumage, mais ne répondent pas de la même manière aux membres de leur espèce avec une couleur différente. Et il s’avère que Mère Nature n’a pas fini de bricoler le génome du moucherolle.
« Nous constatons qu’il existe une troisième population mélanique (toute noire) de moucherolles parmi les îles à environ 300 miles de l’île d’origine », a déclaré le co-auteur principal Al Uy, professeur de biologie à l’Université de Rochester. « La mutation qui régit la couleur de leur plumage est encore une fois différente de celles des deux autres îles que nous avons étudiées. »
Uy étudie les gobe-mouches des îles Salomon depuis environ 15 ans, aidé par un groupe d’indigènes de confiance qui, selon lui, ont joué un » rôle déterminant » dans son travail. « Je pense que la tendance émergente est qu’il y a quelque chose dans les petites îles qui favorise ces oiseaux entièrement noirs – dans l’archipel le plus éloigné où le mélanisme a évolué pour la troisième fois, nous avons constaté que les oiseaux mélaniques et à ventre marron coexistent toujours dans chaque l’île, mais à mesure que les îles deviennent plus petites, la fréquence des oiseaux mélaniques augmente. »
Il existe plusieurs théories sur ce qui motive le passage au plumage arrière, y compris la préférence féminine, la plus grande durabilité des plumes noires et même un lien possible avec les gènes qui régissent d’autres comportements avantageux. Les auteurs de l’étude incluent les informaticiens Ziyi Mo et Adam Siepel du Cold Spring Harbor Laboratory, qui ont écrit le programme d’apprentissage automatique qui a aidé les chercheurs à creuser plus profondément dans le passé et à mesurer les modèles de mutation dans « l’arbre généalogique » des moucherolles.
« L’utilisation de l’apprentissage automatique est un nouveau développement passionnant dans le domaine de la génétique des populations », a déclaré Campagna. « Nous entraînons l’ordinateur à reconnaître des schémas évolutifs spécifiques pour savoir quand un trait génétique particulier a commencé, à quel point la sélection naturelle ou sexuelle était forte et à quelle vitesse il s’est déplacé dans une population. Nous pouvons ensuite demander à l’algorithme formé de nous dire le scénario le plus probable qui a généré les données que nous observons dans les populations actuelles. C’est comme remonter dans le temps. »
Plus d’information:
Leonardo Campagna et al, Des balayages sélectifs sur différents gènes de pigmentation médiatisent l’évolution convergente du mélanisme insulaire chez deux espèces d’oiseaux naissantes, Génétique PLOS (2022). DOI : 10.1371/journal.pgen.1010474