Selon une étude publiée dans Microbiome environnemental.
Les villes sont construites pour l’habitation humaine, mais sont aussi des espaces qui abritent un large éventail d’espèces vivantes, et la compréhension de ce paysage diversifié est importante pour l’urbanisme et la santé humaine. Cependant, l’échantillonnage du paysage microbien de manière à couvrir de vastes zones d’une ville peut demander beaucoup de travail.
Elizabeth Hénaff et ses collègues ont étudié le potentiel des abeilles mellifères (Apis mellifera) pour aider à recueillir des échantillons de micro-organismes dans les villes, car les abeilles mellifères sont connues pour se nourrir quotidiennement jusqu’à un mile de leurs ruches en milieu urbain. Ils ont échantillonné divers matériaux de trois ruches à New York dans le cadre d’une étude pilote et ont trouvé diverses informations génétiques, notamment de bactéries environnementales, dans les débris accumulés au fond des ruches. Des échantillons ultérieurs de débris de ruche à Sydney et Melbourne (Australie), Venise (Italie) et Tokyo (Japon) suggèrent que chaque emplacement a une signature génétique unique telle que vue par les abeilles mellifères.
A Venise, les données génétiques étaient dominées par des champignons liés à la pourriture du bois et à l’ADN du palmier dattier. À Melbourne, l’échantillon était dominé par l’ADN d’eucalyptus, tandis que l’échantillon de Sydney montrait peu d’ADN végétal mais contenait des données génétiques d’une espèce de bactérie qui dégrade le caoutchouc (Gordonia polyisoprenivorans). Les échantillons de Tokyo comprenaient de l’ADN végétal de Lotus et de soja sauvage, ainsi que la levure de fermentation de sauce soja Zygosaccharomyces rouxii. De plus, les auteurs ont compilé du matériel génétique à partir des débris de la ruche pour Rickettsia felis (« fièvre des griffes du chat »), un agent pathogène qui se transmet aux humains par les griffes du chat. Ces résultats indiquent le potentiel de cette méthode de surveillance, mais sont actuellement trop préliminaires pour suggérer qu’il s’agit d’une méthode efficace de surveillance des maladies humaines.
Les débris de la ruche contenaient également des micro-organismes liés aux abeilles, provenant probablement de parties d’abeilles mellifères présentes dans les débris. Sur la base de 33 échantillons provenant des ruches des quatre villes suivantes, les auteurs ont trouvé des micro-organismes d’abeilles connus, dont la présence indique une ruche saine, et dans certaines ruches, des agents pathogènes des abeilles ont été détectés, tels que Paenibacillus larvae, Melissococcus plutonius ou le parasite Varroa destructor. Les auteurs suggèrent que ces résultats indiquent que les débris peuvent également être utilisés pour évaluer la santé globale des ruches.
Les auteurs concluent que les débris de ruche d’abeilles collectés par les abeilles mellifères fournissent un instantané du paysage microbien des environnements urbains et pourraient être utilisés avec d’autres mesures pour évaluer la diversité microbienne et la santé des villes et des abeilles mellifères à leur tour.
Plus d’information:
Elizabeth Hénaff, Holobiont Urbanism : l’échantillonnage des ruches urbaines révèle les métagénomes des villes, Microbiome environnemental (2023). DOI : 10.1186/s40793-023-00467-z. www.biomedcentral.com/articles … 6/s40793-023-00467-z