Les sols urbains contiennent souvent des contaminants chimiques, tels que des métaux lourds ou des traces d’antibiotiques, ainsi que des niveaux élevés de bactéries résistantes aux antibiotiques. De nouvelles recherches menées par l’Université du Maryland suggèrent que, dans certains cas, l’amélioration de la santé des sols urbains grâce au compost et au fumier traité peut réduire la quantité de « mauvaises » bactéries. La compréhension de cette dynamique a des implications importantes pour l’amélioration de la qualité et de la sécurité des produits frais dans l’agriculture urbaine.
L’étude a été publié le Journal de la protection des aliments.
« L’agriculture urbaine rassemble les gens et nous voyons aujourd’hui qu’elle peut contribuer à nettoyer l’environnement, au moins de certaines bactéries résistantes aux antibiotiques », a déclaré Ryan Blaustein, professeur adjoint au département de nutrition et de science alimentaire de l’UMD et auteur de l’étude. « La culture biologique peut favoriser des « microbiomes » végétaux plus sains auxquels nous sommes exposés en tant que consommateurs. »
Les agriculteurs urbains et les jardiniers communautaires amendent souvent leur sol avec des additifs biologiques, comme du fumier animal ou des composts fabriqués à partir de mélanges de matières végétales et de restes de nourriture qui peuvent inclure des fruits et légumes, des œufs, du lait, de la viande ou des déchets de crustacés.
Ces types d’amendements du sol sont réglementés et doivent être correctement compostés ou pasteurisés avant leur application, car ils comportent un risque d’introduction de microbes comme la salmonelle et l’E. coli, responsables de maladies d’origine alimentaire. Mais on sait peu de choses sur les effets potentiels de l’utilisation d’amendements organiques du sol sur la résistance aux antibiotiques des bactéries dans les systèmes alimentaires urbains.
Pour combler cette lacune, Blaustein et ses collègues ont analysé les sols et les légumes verts à feuilles, comme le chou frisé et la laitue, de sept fermes urbaines et jardins communautaires autour de Washington, DC. Ils ont testé les niveaux de bactéries totales et de bactéries résistantes aux antibiotiques comme l’ampicilline et la tétracycline. À chaque endroit, ils ont testé les légumes verts à feuilles ainsi que les sols qui avaient été traités avec du fumier ou du compost et les sols qui n’avaient pas été traités.
Leurs résultats ont montré que les sols amendés traités avec du fumier ou du compost contenaient beaucoup plus de bactéries totales que les sols non traités, mais pas nécessairement plus de bactéries nocives ou de souches résistantes aux antibiotiques. Cela signifie que la proportion de bactéries résistantes et les indicateurs de sécurité alimentaire étaient en fait plus faibles dans le sol amendé. D’autres études doivent être menées pour déterminer les impacts à long terme, mais leurs résultats suggèrent que le fumier et le compost pourraient agir comme des probiotiques pour le sol, en introduisant ou en stimulant peut-être des bactéries bénéfiques qui supplantent et suppriment les bactéries résistantes aux antibiotiques.
Les chercheurs ont également constaté que le pH du sol était fortement associé aux concentrations de bactéries résistantes à la tétracycline, ce qui suggère que la gestion du pH peut être utilisée pour contrôler les risques associés. En outre, ils ont constaté de grandes différences dans les niveaux de bactéries entre les sites, parfois au sein d’une même ferme, en fonction des amendements utilisés et des légumes cultivés. Selon Blaustein, ces résultats soulignent la nécessité de développer une compréhension à l’échelle des systèmes des sols dans les environnements agricoles urbains.
Ces informations ont des implications importantes pour comprendre le rôle du compost et du fumier dans l’amélioration de la santé des sols, la gestion des bactéries nocives et la garantie d’un approvisionnement alimentaire sain en milieu agricole urbain.
Plus d’informations :
Qingyue Zeng et al., Effets des amendements organiques du sol sur les bactéries résistantes aux antimicrobiens dans les environnements agricoles urbains, Journal de la protection des aliments (2024). DOI: 10.1016/j.jfp.2024.100344