L’analyse du transcriptome révèle le mécanisme de régulation par lequel MdWOX11 supprime la formation de pousses dans les pommes

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Récemment, une équipe dirigée par le professeur Dong Zhang du College of Horticulture, Northwest A&F University, a publié un article de recherche intitulé « L’analyse du transcriptome révèle le mécanisme de régulation par lequel MdWOX11 supprime la formation de pousses adventices dans la pomme » dans Recherche horticole.

Les auteurs ont montré que le génotype des feuilles de pommier était un facteur clé affectant leur capacité de formation d’AS, et qu’un rapport CK/IAA approprié pouvait favoriser la formation d’AS. De plus, ils ont découvert que le niveau d’expression de MdWOX11 était négativement corrélé à la capacité de formation de l’AS. Les auteurs ont ensuite analysé les phénotypes des plantes transgéniques MdWOX11 pour démontrer que la surexpression de MdWOX11 supprimait la formation d’AS. L’analyse des hormones endogènes a montré que les tendances de la teneur en hormones différaient entre les lignées transgéniques MdWOX11-RNAi et MdWOX11-OE à trois stades de développement de la SA.

Les auteurs ont ensuite effectué une analyse ARN-seq des lignées transgéniques GL-3 et MdWOX11 à trois stades de développement de la SA et ont identifié 8066 gènes exprimés de manière différentielle (DEG). L’analyse groupée des profils d’expression des gènes liés aux hormones et au développement des pousses dans les plantes transgéniques MdWOX11 au cours de la formation de l’AS a montré que l’expression des gènes liés à la voie de signalisation CK et au développement des pousses était plus élevée dans GL-3 que dans les plantes transgéniques MdWOX11-OE pendant les stades d’émergence du cal et de la SA. Cependant, l’expression du gène de la cytokinine oxydase MdCKX5 était plus élevée dans les plantes transgéniques MdWOX11-OE que dans les plantes transgéniques GL-3 et MdWOX11-ARNi.

Pour identifier les gènes qui agissent en aval de MdWOX11, les auteurs ont effectué un test à un hybride de levure (Y1H), des tests à double luciférase et une ChIP-qPCR. Les résultats ont vérifié la liaison de MdWOX11 au promoteur MdCKX5 et ont indiqué que MdWOX11 améliorait l’activité du promoteur de MdCKX5. Par conséquent, les auteurs ont proposé un modèle de travail par lequel MdWOX11 régule la transcription de MdCKX5 pour médier la formation d’AS dans la pomme. Plus précisément, MdWOX11 se lie au promoteur de MdCKX5 et induit son expression ; MdCKX5 favorise alors la dégradation de la CK et une faible expression des gènes liés à la réponse de la CK inhibe la formation d’AS.

En conclusion, « cette étude met en lumière le mécanisme par lequel MdWOX11 régule la formation d’AS et donne un aperçu de la régulation globale de la formation d’AS dans les porte-greffes de pommier », déclarent les auteurs.

Plus d’information:
Jiangping Mao et al, l’analyse du transcriptome révèle le mécanisme de régulation par lequel MdWOX11 supprime la formation de pousses adventices dans la pomme, Recherche horticole (2022). DOI : 10.1093/h/uhac080

Fourni par l’Université agricole de Nanjing L’Académie des sciences

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