L’analyse de séquençage d’ARN révèle les gènes clés à l’origine de la variation de la peau de l’aubergine

Les anthocyanes donnent aux fruits et légumes leurs couleurs rouge, violette et bleue, offrant des bienfaits pour la santé. Leur biosynthèse implique des enzymes spécifiques et est régulée par le complexe de facteurs de transcription MBW. La recherche a lié les variations de couleur des plantes à la teneur et à la structure des anthocyanes, les analyses transcriptomiques révélant les gènes impliqués dans ces différences.

Chez les aubergines, SmMYB113 a été identifié comme un régulateur clé de la biosynthèse des anthocyanes, affectant la couleur de la peau. Malgré les progrès, les mécanismes moléculaires précis à l’origine de la diversité des couleurs des aubergines restent flous, ce qui indique la nécessité de poursuivre les recherches sur la biosynthèse et la régulation des anthocyanes.

Recherche horticole recherche publiée intitulée « L’analyse du séquençage de l’ARN révèle de nouveaux gènes impliqués dans la formation des différentes couleurs de la peau de l’aubergine« .

Premièrement, les modèles d’expression des gènes de biosynthèse des anthocyanes dans des aubergines de différentes couleurs et stades de développement ont été explorés, et il a été constaté que les gènes de biosynthèse des anthocyanes étaient davantage exprimés dans les variétés d’aubergines violettes, en particulier au stade de croissance rapide.

Une analyse séquencée d’ARN a été réalisée sur la peau d’aubergine au stade G afin d’identifier les gènes différentiellement exprimés (DEG) liés à la biosynthèse des anthocyanes et des flavonoïdes. En particulier, des gènes spécifiques, notamment SmMYB113 et WRKY44, étaient régulés positivement dans les cultivars présentant des ratios delphinidine/flavonoïde plus élevés, ce qui suggère leur implication dans la variation de couleur. En outre, l’étude a découvert 27 nouveaux gènes potentiellement liés aux différences de couleur et 32 ​​nouveaux gènes au sein du réseau de biosynthèse des anthocyanes régulé par SmMYB113.

Notamment, cinq gènes (SmCytb5, SmGST, SmMATE, SmASAT3 et SmF3’5’M) ont été identifiés comme étant cruciaux à la fois pour la variation de couleur et pour l’accumulation d’anthocyanes. L’expression de ces cinq gènes a été directement activée par SmMYB113 via un essai de déplacement de mobilité électrophorétique sur un hybride de levure et des expériences de double luciférase.

Dans l’ensemble, la recherche élucide non seulement la base transcriptionnelle de la variation de couleur dans les pelures d’aubergines, mais met également en évidence le rôle central de SmMYB113 dans la régulation de la biosynthèse des anthocyanes, offrant ainsi des informations sur les futures stratégies génétiques et de sélection visant à améliorer la coloration des fruits.