Des scientifiques ont développé une nouvelle méthode de comptage des protéines marquées dans les cellules vivantes qui pourrait devenir un outil standard et précieux dans le domaine de la recherche biomédicale.
Cette nouvelle technique puissante, connue sous le nom de Protein-tag Degree of Labeling (ProDOL), fournit une approche robuste et polyvalente pour déterminer avec précision l’efficacité de l’étiquetage, le nombre de protéines marquées avec des marqueurs fluorescents dans les cellules vivantes, en microscopie, un aspect crucial de la quantification des protéines dans la recherche biologique.
La méthode a été développée par une équipe de chercheurs des sciences cardiovasculaires et de l’école de chimie de l’université de Birmingham, en collaboration avec plusieurs institutions internationales. Les résultats, qui soulignent le potentiel de ProDOL pour améliorer considérablement la précision et la fiabilité de l’étiquetage des protéines, ont été publiés dans une étude récente publiée dans Méthodes de la nature.
La microscopie à fluorescence est depuis longtemps une pierre angulaire de la recherche biomédicale, permettant aux scientifiques de détecter et d’analyser les protéines dans les cellules. Cependant, la précision de ces analyses dépend fortement de la capacité à déterminer le nombre de protéines marquées par des marqueurs fluorescents, un paramètre connu sous le nom de degré de marquage (DOL). Les méthodes existantes de mesure du DOL ont des limites, ce qui se traduit souvent par des efficacités de marquage variables et des signaux non spécifiques.
« ProDOL est conçu pour répondre à ces défis en fournissant une méthode rapide et fiable pour quantifier l’efficacité du marquage », a déclaré le professeur Dirk-Peter Herten, chercheur principal en sciences cardiovasculaires à l’université de Birmingham. « Cet outil permet d’optimiser les stratégies de marquage des protéines et fournit des mesures précises du nombre de copies de protéines dans les structures cellulaires. »
« Grâce à sa précision et à son adaptabilité éprouvées, ProDOL est appelé à devenir un outil standard et précieux dans le domaine de la recherche biomédicale, ouvrant la voie à des études plus précises et plus approfondies des fonctions cellulaires. Il est également très polyvalent, ce qui le rend applicable à divers types de cellules et conditions expérimentales.
« À l’avenir, cela pourrait, par exemple, améliorer notre compréhension des processus de signalisation cellulaire dans l’activation des cellules immunitaires ou des plaquettes qui sont pertinentes dans le contexte de diverses maladies, y compris, mais sans s’y limiter, l’inflammation, les déficiences immunitaires et diverses maladies cardiovasculaires. »
Applications concrètes et orientations futures
Dans l’étude, ProDOL a été appliqué pour étudier comment le virus VIH-1 affecte la réponse des cellules immunitaires T CD4.
En collaboration avec le professeur Oliver Fackler du département des maladies infectieuses et de virologie intégrative de l’hôpital universitaire de Heidelberg, cette étude a démontré l’efficacité de ProDOL dans la mesure du nombre total et activé de copies en comptant le nombre total et actif de protéines auxiliaires dans de minuscules groupes de signalisation de cellules immunitaires.
De plus, la professeure Ursula Klingmüller de la division de biologie des systèmes de transduction du signal du Centre allemand de recherche sur le cancer (DKFZ) a contribué à la conception des sondes pour les applications sur cellules vivantes, garantissant la robustesse et l’applicabilité de la technique dans les systèmes biologiques dynamiques.
Plus d’information:
ProDOL : une méthode générale pour déterminer le degré d’étiquetage pour l’optimisation de la coloration et le comptage moléculaire, Méthodes de la nature (2024). DOI : 10.1038/s41592-024-02376-6