Dans une étude publié dans le journal Sciences Chine Sciences de la vieLe groupe de Jianing Yu de l’Université normale du Shaanxi et le groupe de Yuxian Zhu de l’Université de Wuhan ont assemblé un génome de durian de référence de 777,8 Mb avec 28 chromosomes et 38 728 gènes codant pour des protéines.
Les génomes de haute qualité du durian ont permis aux auteurs de reconstituer un caryotype ancestral à partir de 11 protochromosomes partagés par les plantes Malvaceae et les trajectoires d’évolution pour former sa structure génomique actuelle. Grâce à une analyse génomique comparative, les auteurs ont identifié que le durian a subi un événement WGT il y a environ 20 (17-24) millions d’années.
Les auteurs ont également constaté que les gènes WGD étendus étaient particulièrement enrichis dans le module de biosynthèse de la lignine de la voie du phénylpropane, ce qui suggère que le récent WGD chez le durian pourrait avoir favorisé la diversification et la spécialisation de cette voie particulière, ce qui est important pour le développement de ses épines de fruits caractéristiques.
L’expansion des familles de gènes des facteurs de transcription, ainsi que la régulation positive notable d’une famille spécifique de facteurs de choc thermique et de plusieurs protéines de choc thermique, ont potentiellement permis d’obtenir un durian doté d’un système sophistiqué et robuste capable de résister à des conditions thermiques extrêmes.
Plus d’information:
Wanwan Li et al, Le génome amélioré du durian révèle le rôle du remaniement des chromosomes au cours de l’évolution du caryotype ancestral, de la régulation de la biosynthèse de la lignine et de la tolérance au stress, Sciences Chine Sciences de la vie (2024). DOI: 10.1007/s11427-024-2580-3