Les molécules induites par la lumière pour faire tourner des groupes volumineux autour de liaisons centrales pourraient être transformées en systèmes bioactifs photo-activés, en commutateurs moléculaires, etc.
Des chercheurs de l’Université d’Hokkaido, dirigés par le professeur adjoint Akira Katsuyama et le professeur Satoshi Ichikawa de la Faculté des sciences pharmaceutiques, ont étendu la boîte à outils de la chimie synthétique en créant une nouvelle catégorie de molécules pouvant être amenées à subir une rotation interne lors de l’interaction avec la lumière. On pense que des processus similaires sont importants dans certains systèmes biologiques naturels.
Les versions synthétiques pourraient être exploitées pour remplir des fonctions de commutation photochimique dans les technologies de calcul et de détection moléculaires ou dans les molécules bioactives, y compris les médicaments. Leur rapport est attendu dans Chimie naturelle.
« La réalisation d’un système comme le nôtre a constitué un défi important en photochimie », explique Katsuyama. « Ce travail apporte une contribution importante à un domaine émergent de la manipulation moléculaire. »
L’examen de certaines protéines naturelles a permis de mieux comprendre les possibilités pour la lumière de modifier de manière significative les conformations moléculaires. Il s’agit notamment des molécules de rhodopsine présentes dans la rétine de l’œil, qui jouent un rôle crucial dans la conversion de la lumière en signaux électriques qui créent notre sens de la vision dans le cerveau. Des détails apparaissent sur la façon dont l’absorption de l’énergie lumineuse peut induire un réarrangement en torsion d’une partie de la molécule de rhodopsine nécessaire pour qu’elle remplisse sa fonction biologique.
« Imiter cela dans des systèmes synthétiques pourrait créer des commutateurs au niveau moléculaire avec diverses applications potentielles », explique Katsuyama.
Une innovation clé de l’équipe d’Hokkaido a été de réaliser une rotation photo-induite (c’est-à-dire induite par la lumière) de groupes moléculaires autour d’une série de liaisons chimiques qui incorporent un atome d’azote avec d’autres atomes de carbone liés.
Les propriétés de rotation ont été obtenues en ajoutant des composants moléculaires contenant un atome du groupe d’éléments « chalcogène » du tableau périodique, en particulier le soufre ou le sélénium, à une molécule organique simple : un composé amide. Cela a apporté un nouveau niveau de contrôle et de polyvalence aux systèmes de rotation synthétiques photo-induits.
Certains des groupes chimiques qui tournent autour des liaisons centrales étaient relativement grands, basés sur des anneaux de six atomes de carbone liés. Cela a facilité les changements moléculaires à grande échelle qui pourraient être nécessaires pour une utilisation pratique dans les systèmes de commutation moléculaire.
En plus de démontrer les changements photo-induits, l’équipe a également effectué des calculs théoriques qui ont donné un aperçu des mécanismes probables par lesquels les réarrangements se sont déroulés. L’équipe a également exploré les effets de la température sur les transformations. La combinaison de travaux théoriques et expérimentaux devrait contribuer à orienter les recherches futures vers l’exploration et le contrôle des modifications des systèmes déjà réalisés.
« Notre prochaine priorité de recherche se concentre sur le potentiel de nos méthodes pour fabriquer de nouvelles molécules bioactives activées par la lumière. Celles-ci pourraient être appliquées à la recherche biologique ou éventuellement développées comme médicaments », conclut Ichikawa.
Utiliser la lumière pour activer les changements conformationnels permet de contrôler où et quand les changements se produisent. Cela pourrait être vital pour des applications précisément ciblées dans les systèmes biologiques, y compris d’éventuelles possibilités thérapeutiques.
Une version de l’étude est disponible sur le journal ChemRxiv serveur de pré-impression.
Plus d’information:
Shotaro Nagami et al, Rotation photoinduite concertée à double liaison simple d’un système contenant de l’azote réalisée par substitution de chalcogène, ChemRxiv (2022). DOI : 10.26434/chemrxiv-2022-4hq5r