Explorer la diversité génétique des nouvelles accessions d’amandiers

Dans le but d’améliorer la diversité génétique des amandes pour répondre à la demande mondiale en constante expansion, les chercheurs ont fouillé une collection privée de matériel génétique d’amandiers, mettant en lumière le potentiel de nouveaux cultivars adaptés à diverses conditions de croissance.

L’étude, menée par le Service de recherche agricole du Département de l’agriculture des États-Unis, National Plant Germplasm System (NPGS), en collaboration avec l’ancienne Fondation pour l’amélioration des plantes vivaces pour l’alimentation et la bioénergie (IPPFBE), explore la diversité génétique de 94 accessions d’amandes nouvellement disponibles. , provenant principalement des pays d’Asie centrale.

Amandes [Prunus dulcis (Mill.) D.A. Webb] sont peut-être le membre le plus économiquement important du genre Prunus L. Les noyaux d’amandes comestibles sont consommés par les humains depuis au moins 11 000 avant notre ère.

Avec une production mondiale actuelle de 4,1 millions de tonnes et en augmentation, il est crucial d’explorer de nouvelles voies pour le développement de cultivars d’amandiers, en particulier dans les régions situées au-delà des zones de culture traditionnelles. Des défis tels que les ressources en eau limitées et l’instabilité climatique soulignent encore davantage la nécessité de cultivars innovants, notamment ceux adaptés aux conditions salines.

Les ressources phytogénétiques, sous la forme de collections de matériel génétique, sont un élément précieux des efforts de sélection et de développement de cultivars, car elles peuvent contenir de nouveaux allèles supérieurs pour des caractères d’intérêt existants ou pour faire face aux changements des facteurs de stress abiotiques et des pathogènes.

L’étude a comparé la diversité génétique de la collection privée de matériel génétique de l’IPPFBE, qui se concentre sur les origines d’Asie centrale, avec la collection NPGS existante conservée près de Davis, en Californie. Grâce aux empreintes génétiques utilisant 10 marqueurs de répétition de séquence simples, cette recherche a révélé un aperçu de la diversité de ces accessions d’amandiers.

Le regroupement hiérarchique, l’analyse en composantes principales (ACP) et l’analyse discriminante des composantes principales (DAPC) ont été utilisés pour analyser et comparer la constitution génétique des collections.

Les résultats ont indiqué que même s’il existe de grandes similitudes entre les collections de l’IPPFBE et du NPGS, le nouveau matériel de la collection privée contribue de manière significative à la diversité génétique du matériel génétique des amandiers. Ce travail a notamment montré des relations étroites entre certaines accessions et identifié des erreurs d’étiquetage ou des duplications potentielles. Deux accessions de Prunus bucharica de la collection IPPFBE se sont démarquées, présentant des traits génétiques distinctifs par rapport au reste de la collection.

Les amandes sont une culture économiquement importante et saine dont les superficies sont en expansion. Cette expansion encourage le développement de nouveaux cultivars adaptés à de nouvelles zones de culture, et un nouveau matériel génétique peut être la source des allèles nécessaires à l’adaptation dans ces emplacements.

Les collections de matériel génétique du NPGS et de l’IPPFBE contiennent toutes deux de nombreuses accessions provenant du centre d’origine de l’amandier. L’analyse de la collection IPPFBE indique que, même si celle-ci et la collection NPGS sont globalement similaires, le nouveau matériel contribue positivement à la diversité génétique du matériel génétique des amandiers.

L’étude est publié dans le Journal de la Société américaine pour la science horticole.

Plus d’information:
Selon McCord et al, Diversité génétique des accessions d’amandes nouvelles provenant du matériel génétique d’Asie centrale et d’Amérique du Nord adapté au froid, Journal de la Société américaine pour la science horticole (2023). DOI : 10.21273/JASHS05292-23

Fourni par la Société américaine pour la science horticole

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