Dynamique bactérienne du biofilm et modifications de la densité d’azote inorganique dues à la présence de moules perlières d’eau douce

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Les moules perlières d’eau douce se trouvent dans les rivières du Japon. Cependant, ils sont en grave déclin et figurent sur la liste rouge en voie de disparition désignée par le ministère de l’Environnement. Les moules perlières d’eau douce sont connues pour jouer un rôle important dans l’écosystème biochimique des éléments nutritifs des rivières dans la région et en aval. Kayano Takeuchi, diplômée de la Faculté d’agriculture de l’Université de Shinshu, et son père Motoi Takeuchi, se sont efforcés de collecter des échantillons d’eau et du biofilm de 14 rivières à travers le Japon afin d’étudier les espèces et l’écosystème de manière non invasive. Ils ont utilisé des carreaux de céramique pour collecter le biofilm et ont utilisé le séquençage de nouvelle génération d’amplicons de gènes ARNr 16S bactériens de biofilms et ont analysé l’ADN génomique extrait des échantillons, les composés azotés inorganiques et la concentration de chlorophylle.

Le groupe de recherche a découvert que dans les rivières où les moules étaient présentes, il y avait une différence significative d’ammoniac ainsi que de nitrate dans le biofilm par rapport aux cours d’eau où aucune moule n’était présente. Les bactéries appartenant aux Bacteroidales chez Baceroidetes et Clostridiales chez Firmicutes ont été principalement trouvées dans les échantillons où les moules étaient présentes. Les moules peuvent contribuer à atténuer les carences en azote en jouant un rôle dans la distribution, le stockage et le recyclage des nutriments. Les sites de moules et sans moules étaient similaires en taille et en chimie de l’eau.

Le professeur Yutaka Uyeno espère que cette étude confirme l’idée que toute signification de la vie peut être mise en évidence avec des dispositifs scientifiques quantitatifs. Nous avons encore beaucoup à apprendre sur le rôle des biodépôts dans la dynamique des nutriments. Des recherches plus approfondies sont nécessaires pour clarifier le lien entre les moules perlières d’eau douce et leurs écosystèmes. Ce n’est que dans les rivières où se trouvent les moules que les bactéries se sont diversifiées.

La recherche a été publiée dans la revue, msphère.

Plus d’information:
Kayano Takeuchi et al, Dynamique bactérienne du biofilm et modifications de la densité d’azote inorganique dues à la présence de moules perlières d’eau douce, msphère (2022). DOI : 10.1128/msphere.00834-21

Fourni par l’Université de Shinshu

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