La propagation des microbes résistants aux médicaments est devenue un problème de santé mondial qui menace notre capacité à traiter les infections. L’utilisation généralisée d’antimicrobiens dans le bétail, comme les élevages porcins, exacerbe ce problème. Par conséquent, nous avons besoin de systèmes de surveillance pour surveiller ces microbes afin de soutenir les autorités de santé publique. À cette fin, les chercheurs ont suivi la résistance aux antimicrobiens d’Escherichia coli isolée du porc.
Les antimicrobiens sont essentiels pour prévenir et traiter les infections chez les humains et les animaux. Selon la Food and Drug Administration des États-Unis, 70 % de toutes les ventes d’antibiotiques aux États-Unis sont utilisées pour la production animale. Cependant, les microbes changent avec le temps pour combattre ces produits chimiques, devenant finalement résistants. En conséquence, les infections deviennent plus difficiles à traiter. En ce qui concerne, ces organismes résistants peuvent se propager des animaux de ferme aux humains, créant une crise sanitaire plus importante.
Les chercheurs se sont concentrés sur E. coli puisque ces bactéries sont omniprésentes dans le tractus intestinal des humains et des porcs, et qu’elles sont de bons indicateurs pour tester si la viande et les produits carnés ont été contaminés. E. coli peut également acquérir et transférer des gènes de résistance à d’autres bactéries dans le tractus intestinal, ce qui les rend idéales pour les programmes de surveillance du bétail et des humains.
« Il est important de surveiller l’émergence de bactéries résistantes aux antimicrobiens dans l’industrie porcine, car en 2022, les États-Unis étaient le troisième producteur et consommateur de viande et de produits porcins, après l’Union européenne et la Chine », a déclaré Hamid Reza Sodagari, chercheur postdoctoral. chercheur associé au laboratoire Varga. « Bien qu’il s’agisse d’un gros problème, à notre connaissance, cet article est la première étude de surveillance aux États-Unis qui examine la résistance aux antimicrobiens chez E. coli des porcs à l’abattage. »
L’étude a utilisé des données de surveillance accessibles au public sur des échantillons de caecum, qui ont été prélevés dans l’intestin après l’abattage. Les chercheurs se sont concentrés sur le marché des porcs et des truies aux États-Unis entre 2013 et 2019, et ont utilisé les données compilées par le Service d’inspection de la sécurité alimentaire du Département de l’agriculture des États-Unis dans le cadre du programme National Antimicrobial Resistance Monitoring System for Enteric Bacteria.
« Les agences fédérales n’ont souvent pas la main-d’œuvre nécessaire pour effectuer des analyses aussi détaillées et à long terme. Alternativement, pour la plupart des chercheurs, de telles études sont difficiles car elles suivent généralement des échantillons à plus petite échelle. Dans cet article, cependant, nous avons pu examinez plus de 3 000 échantillons sur plusieurs années », a déclaré Csaba Varga (IGOH), professeur adjoint d’épidémiologie.
En utilisant différentes méthodes statistiques, les chercheurs ont découvert que depuis 2013, le nombre d’antimicrobiens auxquels E. coli est résistant est resté stable ou a augmenté au fil des ans. En particulier, la résistance à la ceftriaxone, un médicament antimicrobien important en médecine humaine et vétérinaire, est passée de 0,8 % en 2013 à 7,7 % en 2019. Même si ces chiffres ne sont pas élevés par rapport à la résistance aux autres antimicrobiens, la tendance à la hausse est concernant.
« Nous ne savons pas pourquoi il y a une tendance à la hausse. Cela peut être causé par des éléments génétiques mobiles, qui peuvent transférer la résistance aux antimicrobiens d’une bactérie à une autre. Nous devons faire d’autres recherches au niveau moléculaire pour comprendre la raison de l’augmentation. » « , a déclaré Sodagari.
« Nous ne blâmons personne pour ce problème. Notre étude vise à montrer qu’il y a un problème et que les systèmes de surveillance sont très importants pour montrer les changements de résistance », a déclaré Varga. « En rassemblant ces données, nous espérons que les autorités de santé publique seront en mesure de développer des stratégies d’atténuation. »
L’étude « Evaluating Antimicrobial Resistance Trends in Commensal Escherichia coli Isolated from Cecal Samples of Swine at Slaughter in the United States, 2013-2019 » a été publiée dans Micro-organismes.
Plus d’information:
Hamid Reza Sodagari et al, Évaluation des tendances de la résistance aux antimicrobiens chez les Escherichia coli commensaux isolés à partir d’échantillons cæcaux de porcs à l’abattage aux États-Unis, 2013-2019, Micro-organismes (2023). DOI : 10.3390/microorganismes11041033