Le Département américain de l’Agriculture et du Service de recherche agricole (USDA-ARS) a annoncé que des chercheurs ont reclassé le nombre de souches du virus de la peste porcine africaine (PPA) de 25 à seulement six génotypes uniques. Cette innovation scientifique pourrait aider à redéfinir la façon dont les chercheurs de la PPA du monde entier classent les isolats du virus de la PPA (PPA) et pourrait permettre aux scientifiques de développer plus facilement des vaccins correspondant aux différentes souches circulant dans les zones d’endémie de la PPA à travers le monde.
Le travail est publié dans la revue Virus.
« Auparavant, 25 génotypes de virus différents ont été identifiés à travers le monde », a déclaré Douglas Gladue, scientifique principal de l’ARS. « Notre équipe de recherche a récemment réévalué toutes les séquences d’ADN du virus accessibles au public et a découvert que la majorité des génotypes (constitution génétique) initialement identifiés comme nouveaux n’étaient pas correctement identifiés ni comparés aux génotypes du virus PPA déjà existants. Sur la base de cette analyse, il existe en fait, il y a moins de génotypes uniques que ne le pensait la communauté des chercheurs sur la PPA, ce qui signifie qu’il y a moins de diversité de virus de la PPA affectant les communautés à travers le monde. Cette information est importante car elle peut réduire le nombre de vaccins que l’on pensait auparavant nécessaires pour se protéger contre tous les génotypes du virus de la PPA. « .
Une classification précise des virus est primordiale pour les enquêtes épidémiologiques et le développement de contre-mesures rentables, notamment la conception de vaccins contre des souches uniques du virus de la peste porcine africaine.
Cet effort à grande échelle a impliqué les chercheurs de l’ARS qui ont réanalysé plus de 12 000 isolats de virus historiques et actuels produits dans les laboratoires du virus PPA du monde entier. Cet effort a été rendu possible grâce à la puissance de calcul de SciNet, le cluster de superordinateurs de l’ARS destiné à résoudre les problèmes liés au Big Data agricole.
Bien que le virus PPA entraîne de lourdes pertes économiques pour l’industrie porcine mondiale, il n’y a eu aucune épidémie aux États-Unis. Le virus hautement contagieux de la PPA s’est propagé de l’Afrique à la République de Géorgie en 2007, et a depuis balayé l’Europe, la République dominicaine et l’Asie, avant d’atteindre l’Afrique du Sud au début de 2023. Le virus est incapable de se transmettre du porc à l’homme.
Cette recherche comprend la contribution à la recherche et au développement du National Bio and Agro-Defense Facility, de l’Agence canadienne d’inspection des aliments et de l’Université Makerere en Ouganda.
Plus d’information:
Edward Spinard et al, Une réévaluation des génotypes de la peste porcine africaine basée sur des séquences p72 révèle l’existence de seulement six groupes p72 distincts, Virus (2023). DOI : 10.3390/v15112246