Découvrir l’histoire génétique des loutres britanniques

De nouvelles recherches génétiques ont révélé comment les loutres britanniques ont pu se remettre de la disparition d’espèces dans les années 1950 avec l’aide de leurs homologues asiatiques.

À l’aide de données de séquençage du génome, une équipe du projet Otter de l’université de Cardiff a montré qu’une grande partie de la diversité génétique des loutres britanniques avait été perdue lorsque la pollution chimique a entraîné un grave déclin de la population dans les années 1950-1970.

L’article, « La génomique révèle une histoire complexe de la population et une diversité inattendue des loutres eurasiennes (Lutra lutra) en Grande-Bretagne par rapport aux méthodes génétiques », a été publié. publié dans Biologie moléculaire et évolution.

« Sur la base des registres de chasse aux loutres, la population de loutres a diminué en Grande-Bretagne au cours des années 1950. Les enquêtes ont lié ce déclin à l’accumulation de composés chimiques nocifs dans l’environnement. Après l’interdiction de ces produits chimiques, le rétablissement de la population de loutres a été présenté comme une réussite en matière de conservation, mais le La structure génétique actuelle reflète toujours les populations restantes qui ont survécu à la quasi-extinction », a déclaré Sarah Du Plessis, du Cardiff University Otter Project.

L’équipe a ensuite appliqué de nouveaux outils génomiques pour étudier l’évolution de la population de loutres en Grande-Bretagne, en utilisant le séquençage de l’ADN du génome entier.

Ils ont révélé que l’histoire des loutres britanniques est beaucoup plus complexe qu’on ne le pensait auparavant et constituent la première preuve des conséquences génétiques du déclin de la population des années 1900, ainsi que de la manière dont celles-ci variaient à travers la Grande-Bretagne. Ils ont montré que les loutres de l’est et du sud-ouest de l’Angleterre ont connu de graves goulets d’étranglement dans leur population vers 1950-1980, atteignant une taille de population très petite.

« Cependant, au Pays de Galles, les preuves génétiques suggèrent que le déclin de la population a commencé beaucoup plus tôt, dans les années 1800, tandis que les populations de loutres du nord de l’Angleterre et de l’Écosse ont montré des signes d’un déclin étendu de la population au cours des 800 dernières années. Ensemble, ces résultats suggèrent une image plus complexe de la situation. facteurs de stress environnementaux sur la population de loutres que ce qui était reconnu auparavant », a ajouté Du Plessis.

Les chercheurs ont également découvert de nouvelles données génétiques sur le rôle joué par les loutres d’Asie dans le rétablissement de l’espèce au Royaume-Uni.

« Étonnamment, nous avons également trouvé des preuves que l’augmentation ultérieure de la diversité génétique des loutres britanniques était liée aux translocations de loutres captives d’Asie vers le Royaume-Uni. Les loutres d’Asie ont contribué au pool génétique britannique, renforçant la variation génétique locale et introduisant une lignée génétique autrement. on ne le trouve qu’en Asie.

« En fouillant dans les registres d’élevage en captivité des loutres au Royaume-Uni, nous avons découvert qu’un petit nombre de loutres importées de Thaïlande vers les années 1960 pourraient avoir été accidentellement introduites dans le pool génétique à cette époque. La prochaine question passionnante de notre travail sera donc de savoir si cette augmentation de la diversité génétique des loutres britanniques pourrait aider à protéger nos loutres contre un futur déclin de la population », a ajouté Du Plessis.

Le Cardiff University Otter Project est un programme de surveillance environnementale à long terme, utilisant des loutres trouvées mortes pour étudier les contaminants, les maladies et la biologie des populations à travers le Royaume-Uni. Ce travail a été réalisé par le Cardiff University Otter Project en collaboration avec des scientifiques du Wellcome Sanger Institute et du Zoo national Smithsonian et Université George Mason.

Plus d’information:
Sarah J du Plessis et al, La génomique révèle une histoire complexe de la population et une diversité inattendue des loutres eurasiennes (Lutra lutra) en Grande-Bretagne par rapport aux méthodes génétiques, Biologie moléculaire et évolution (2023). DOI : 10.1093/molbev/msad207

Fourni par l’Université de Cardiff

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