L’anthracnose des fruits (AFR), causée par le champignon pathogène Colletotrichum fioriniae, est la maladie des fruits la plus destructrice et la plus répandue du bleuet, ayant un impact sur la qualité et le rendement des fruits. Le recours aux fongicides nécessite des solutions durables, soulignant l’importance de la sélection de cultivars résistants à l’AFR. La recherche indique que les glycosides de quercétine présents dans les myrtilles possèdent des propriétés antifongiques potentielles contre l’AFR, mais les fondements génétiques et biochimiques de la résistance sont mal compris. Ce manque de connaissances souligne l’urgence d’explorer les bases génétiques et les défenses phytochimiques contre l’AFR afin de développer des variétés de bleuets respectueuses de l’environnement et résistantes.
En août 2023, Recherche horticole publié une étude intitulée « Découverte de marqueurs génétiques et métabolites associés à la résistance à la pourriture anthracnose des fruits chez le bleuet en corymbe du Nord ».
L’équipe de recherche a utilisé une cartographie d’association, révélant trois locus de traits quantitatifs (QTL) liés à la résistance à l’AFR. Les gènes candidats au sein de ces régions génomiques étaient associés à la biosynthèse de flavonoïdes (par exemple les anthocyanes) et à la résistance aux agents pathogènes. Plus précisément, le SNP sur le chromosome 17 à la position 22 625 275 se trouve dans un locus régulateur candidat à 1,8 kilo bases (Kb) en amont d’une protéine mal caractérisée avec une similarité modérée de 34 % avec la protéine de signalisation de la cytokine d’Arabidopsis AT4G33800.
Un autre SNP sur le chromosome 23 était localisé à proximité d’un facteur de transcription AT2G26580 (Yab5) de la famille YABBY, influençant potentiellement l’activité de la phénylalanine ammoniaque-lyase (PAL), essentielle à la biosynthèse des flavonoïdes. Le SNP du chromosome 28 était associé au gène GGL17 d’Arabidopsis (AT3G11210), une estérase de type hydrolase SGNH, impliquée dans les processus métaboliques des anthocyanes.
En outre, l’équipe a examiné les changements d’expression génique dans les fruits après l’inoculation de C. fioriniae et a révélé un enrichissement des gènes associés à certaines voies métaboliques spécialisées (par exemple la biosynthèse des flavonols) et à la résistance des agents pathogènes. Le profilage des métabolites non ciblés a identifié un glycoside de flavonol, cohérent avec le rhamnoside de quercétine, significativement plus abondant chez les individus résistants. Le rôle de ce composé dans la résistance à l’AFR était conforté par sa concentration plus élevée dans les lignées résistantes, bien que la variabilité au sein des groupes suggère un mécanisme de résistance complexe ne dépendant pas uniquement de ce composé.
Dans l’ensemble, cette étude fournit des informations précieuses sur les fondements génétiques et biochimiques de la résistance à l’AFR chez les bleuets, en mettant en évidence des régions génomiques spécifiques, des gènes candidats et des métabolites qui pourraient faciliter la sélection de cultivars résistants, améliorant ainsi la durabilité de la production de bleuets.
Plus d’information:
MacKenzie Jacobs et al, Découverte de marqueurs génétiques et métabolites associés à la résistance à la pourriture anthracnosique des fruits chez le bleuet en corymbe du Nord, Recherche horticole (2023). DOI : 10.1093/hr/uhad169
Fourni par BioDesign Research