Un nouveau papier dans Biologie moléculaire et évolution fournit, pour la première fois, un ensemble complet de ressources génomiques pour les pangolins (parfois appelés fourmiliers écailleux) qui, selon les chercheurs, seront essentielles à la protection de ces mammifères menacés.
Le travail est intitulé « Les génomes des pangolins offrent des informations et des ressources clés pour les mammifères sauvages les plus victimes de trafic au monde ».
Les pangolins, que l’on trouve en Asie et en Afrique subsaharienne, sont les seuls mammifères couverts d’écailles. Ils font l’objet d’un trafic en nombre record pour leur viande et leurs prétendues propriétés médicinales. Les animaux sont également en danger en raison de la déforestation généralisée de leurs habitats naturels. Les pangolins sont constitués de huit espèces survivantes qui sont devenues d’un grand intérêt public et d’efforts de conservation ces dernières années. Cela est principalement dû au fait qu’ils sont les mammifères sauvages les plus traqués sur Terre et à la récente suggestion (incorrecte) selon laquelle ils pourraient avoir été liés à la pandémie de COVID-19.
Malgré leurs conditions de conservation désastreuses, les pangolins sont sous-étudiés, et des lacunes majeures subsistent dans la recherche fondamentale sur les espèces ou les populations. Les chercheurs se concentrent désormais de plus en plus sur la génomique dans la recherche sur la faune, car elle fournit des données permettant d’obtenir des informations plus précises sur la démarcation des espèces ou des populations, des informations démographiques, la diversité, les trajectoires historiques et la capacité d’adaptation des animaux aux changements globaux. Cela peut également aider à retracer l’origine des individus faisant l’objet d’un commerce illégal afin de déterminer plus efficacement les points chauds du braconnage et de perturber les réseaux de trafic.
Produire des informations sur l’ensemble du génome des pangolins est une tâche difficile. Premièrement, l’isolement géographique des espèces de pangolins les unes des autres et le nombre limité de fossiles posent des obstacles méthodologiques. Les espèces de pangolins asiatiques et africaines ont divergé il y a environ 37,9 millions d’années, ce qui rend difficile de véritablement comprendre l’évolution du groupe en utilisant le génome de référence d’une espèce lointaine. Deuxièmement, le comportement insaisissable des animaux et leur répartition tropicale rendent l’échantillonnage génétique coûteux et long.
Les chercheurs ont séquencé, assemblé et annoté le premier génome de référence du pangolin géant, originaire d’Afrique, ainsi que les génomes des pangolins à ventre noir, de Temminck, indien et philippin. Ces nouvelles données génomiques, ainsi que les informations précédemment publiées sur les trois espèces restantes – les pangolins à ventre blanc, de la Sonde et chinois – fournissent le premier ensemble complet de génomes pour les pangolins. Au cours de ce processus, les chercheurs ont également identifié une espèce potentiellement nouvelle de pangolin à partir de données génomiques précédemment publiées.
Les chercheurs pensent que ces informations, qui fourniront à terme des informations complètes sur la façon dont les pangolins ont évolué au fil du temps en réponse aux conditions environnementales changeantes, fourniront des détails cruciaux sur la manière de protéger efficacement les animaux grâce aux priorités de conservation et aux plans de gestion dans les années à venir. Les résultats seront également utiles pour développer des boîtes à outils ADN permettant de tracer le commerce des pangolins.
« La manière collaborative de cette étude entre des auteurs d’Afrique, d’Asie et d’Europe nous a permis pour la première fois d’examiner en profondeur l’évolution du pangolin parmi les huit espèces en utilisant une perspective à l’échelle du génome », a déclaré Sean Heighton, l’un des responsables de l’étude. auteurs. « Nous espérons que ces génomes serviront de base à de nouvelles recherches génétiques qui contribueront à la conservation des animaux. »
Plus d’information:
Sean Heighton et al, Les génomes des pangolins offrent des informations et des ressources clés pour les mammifères sauvages les plus trafiqués au monde., Biologie moléculaire et évolution (2023). DOI : 10.1093/molbev/msad190. Academic.oup.com/mbe/article-l… .1093/molbev/msad190