De nouvelles méthodes d’identification des bactéries pourraient aider à accélérer le diagnostic des maladies

Pseudomonas aeruginosa est une souche bactérienne pouvant être responsable de plusieurs maladies humaines. Les plus graves comprennent l’otite externe maligne, l’endophtalmie, l’endocardite, la méningite, la pneumonie et la septicémie.

Les environnements dans lesquels ces bactéries se trouvent le plus fréquemment comprennent le sol, les plantes et l’eau. Ils peuvent même être trouvés sur la peau humaine et animale, sans provoquer de maladie, selon un processus appelé colonisation bactérienne. La recherche microbiologique peut aider à établir la cause de certaines maladies infectieuses, facilitant ainsi le choix du meilleur traitement. C’est pourquoi il est important de trouver un moyen simple et rapide d’identifier ces bactéries.

Un nouveau étudePublié dans BioRisquea exploré cela en appliquant des techniques spectroscopiques pour une analyse rapide directement à partir d’un objet, qui dans ce cas était une peau de tortue.

« Les organismes microbiens jouent un rôle clé dans la santé et l’écologie animales. La tortue d’étang européenne vit souvent dans les jardins des zoos des villes et dans les maisons privées. Souvent, la bactérie la plus fréquemment trouvée à la surface de la peau des tortues était l’espèce Pseudomonas », explique Aleksandrs Petjukevics de l’Université de Daugavpils, dont L’équipe a mené l’étude.

Qu’est-ce que la spectroscopie Raman ?

« Les techniques classiques de recherche microbiologique présentent plusieurs inconvénients : tout d’abord, il s’agit d’un processus assez long. La période minimale est de 3 à 4 jours, mais plusieurs jours, voire plusieurs semaines, peuvent s’écouler avant que l’agent pathogène isolé ne soit identifié avec précision, et des produits chimiques coûteux sont utilisés. et des ressources », déclare Petjukevics.

Alternativement, la spectrométrie permet d’identifier un échantillon préparé d’un micro-organisme tout en réduisant le temps d’identification à 5-30 minutes. Les spectres Raman représentent un ensemble de signaux résultant des vibrations moléculaires des composants cellulaires individuels des bactéries Gram-négatives, s’intégrant sur les protéines, les lipides et les glucides.

« Cette technique d’analyse chimique non destructive fournit des informations détaillées sur la structure chimique, la phase et la polymorphie, la cristallinité et les interactions moléculaires. Elle est basée sur l’interaction de la lumière avec les liaisons chimiques au sein d’un matériau », explique Petjukevics.

Résultats de la recherche et implications

Les résultats de l’étude ont montré que les bactéries Pseudomonas peuvent être rapidement identifiées à l’aide de cette technologie de détection, dotée d’une excellente sensibilité analytique et diagnostique, ce qui en fait une technique fiable. Contrairement à d’autres méthodes, cette technique ne nécessite pas de préparation d’échantillons bactériens à long terme ni de réactifs coûteux, ce qui la rend prometteuse pour l’étude d’autres souches de bactéries.

« Cette étude a démontré la capacité d’obtenir des spectres Raman rapides et de haute qualité de cellules bactériennes en utilisant la spectroscopie vibrationnelle », conclut Petjukevics. « La spectroscopie Raman peut être considérée comme une méthode expresse d’identification des micro-organismes. Elle présente un grand potentiel pour les recherches futures impliquant différents micro-organismes. »

Plus d’information:
Aleksandrs Petjukevičs et al, Perspectives et possibilités d’utilisation de la spectroscopie Raman pour l’identification de Pseudomonas aeruginosa à partir de la peau de la tortue Emys orbicularis (Linnaeus, 1758), BioRisque (2023). DOI : 10.3897/biorisk.21.111983

Fourni par les éditeurs Pensoft

ph-tech