Chaque organisme vivant libère son ADN dans l’environnement, laissant un enregistrement invisible de sa présence.
Cependant, les scientifiques ont trouvé des moyens d’amplifier cet ADN environnemental (eDNA) à partir d’échantillons d’eau, de sol et d’autres échantillons environnementaux, leur permettant d’identifier à qui appartenait l’ADN.
Ces outils de surveillance moléculaire ont une gamme d’applications, y compris la détection de ravageurs ou d’espèces menacées et la surveillance de la biodiversité.
Les scientifiques de la Division antarctique australienne, dont le Dr Anna MacDonald, le Dr Leonie Suter et le Dr Laurence Clarke, utilisent des méthodes eDNA pour identifier la présence d’un ou plusieurs organismes antarctiques, tels que le krill et les poissons, dans l’eau de mer, les excréments de prédateurs et d’autres organismes environnementaux. échantillons. Leur travail fournit de nouvelles informations sur le rôle du krill antarctique dans l’écosystème de l’océan Austral, ses interactions avec les prédateurs et son habitat préféré.
Le trio, ainsi que des scientifiques du CSIRO, de l’Université de Canberra et de plusieurs autres instituts de recherche australiens et néo-zélandais, ont récemment publié deux lignes directrices sur les meilleures pratiques pour les chercheurs et les agences de test eDNA australiens et néo-zélandais, ainsi qu’un aperçu de les lignes directrices du journal ADN environnemental.
Les directives visent à garantir que les méthodes sont standardisées entre les utilisateurs, pour l’assurance qualité et pour maintenir la confiance dans les résultats basés sur l’ADNe.
« Les méthodes eDNA sont passées du statut d’outils de recherche de base à celui d’éléments clés des programmes de surveillance du gouvernement et de l’industrie », a déclaré le Dr MacDonald. « Cela signifie que nous devons nous assurer que les méthodes eDNA sont adaptées à des fins de surveillance. Les programmes de surveillance peuvent durer de nombreuses années. Ainsi, pour créer des ensembles de données à long terme et comparer les résultats dans le temps ou dans des lieux, nous devons utiliser des méthodes fiables et standardisées.
« Ces nouvelles directives garantiront aux gestionnaires de l’environnement des preuves scientifiques solides pour étayer leur prise de décision. Les directives soutiendront également l’évaluation des meilleures méthodes eDNA à utiliser dans des situations où des résultats imprécis ou incorrects pourraient avoir des conséquences financières, éthiques ou juridiques, telles que la biosécurité. . »
Le guide de développement de protocoles d’ADN environnemental pour la biosurveillance fournit des normes minimales pour les projets eDNA, des considérations éthiques et de la conception expérimentale à l’interprétation et à la communication des résultats. Les directives de validation des tests ADN environnementaux décrivent les étapes à suivre dans le développement de tests pour la détection d’une seule espèce ou de plusieurs espèces.
La publication du document de synthèse coïncide avec la conférence inaugurale Australie-Nouvelle-Zélande sur l’eDNA à Hobart du 14 au 17 février 2023.
Les lignes directrices étaient une initiative du ministère australien de l’agriculture, des pêches et des forêts, dirigée par la Southern eDNA Society, en consultation avec des experts et des utilisateurs finaux de l’eDNA.
Plus d’information:
Maarten De Brauwer et al, Lignes directrices sur les meilleures pratiques pour la biosurveillance environnementale de l’ADN en Australie et en Nouvelle-Zélande, ADN environnemental (2023). DOI : 10.1002/edn3.395
Fourni par le programme antarctique australien