Une étude réalisée par l’unité de mycologie et de microbiologie environnementale de l’Université Rovira i Virgili a identifié de nouvelles espèces de champignons susceptibles de provoquer des infections ou des maladies chez les humains et les animaux. Menées dans les écosystèmes fluviaux, les recherches s’inscrivent dans un projet sur la biodiversité et le rôle joué par un grand groupe de champignons, les ascomycètes, dans l’écosystème aquatique.
Il existe très peu d’informations sur ces champignons, notamment ceux qui poussent dans les sédiments. La recherche prévient également qu’en période de sécheresse, certaines espèces pathogènes sont encore plus dangereuses pour la santé humaine.
« Les ascomycètes présents dans les sédiments fluviaux et marins ont été très peu étudiés jusqu’à présent, et ce que nous faisons dans le cadre de ce projet consiste non seulement à élargir la base de connaissances sur les espèces trouvées dans ces sédiments, mais également à déterminer les modèles de biodiversité qui indiquent si un écosystème est en bonne santé ou au contraire a des problèmes de pollution d’origines diverses. »
« En bref, tout changement dans la composition d’une communauté fongique peut être un avertissement que quelque chose ne va pas », explique Joseph Gené, chercheur principal de la recherche.
Certaines espèces de cette communauté peuvent proliférer plus facilement dans certaines conditions et pourraient être utilisées comme bioindicateurs environnementaux. « Mais d’autres champignons sont des agents pathogènes opportunistes des mammifères, des animaux à sang froid et d’autres créatures, qui peuvent provoquer des infections bénignes et graves, non seulement chez les animaux qui vivent dans le milieu aquatique, mais aussi chez ceux qui y passent, comme nous lorsque on se baigne dans une rivière », explique Gené.
Si l’environnement change, par exemple lors d’une sécheresse, ils peuvent être exposés et constituer un risque pour la santé des habitats. « Lorsque les sédiments sont exposés à l’air, ces champignons peuvent commencer à produire de nombreuses spores qui se dispersent à la recherche d’un environnement plus adapté, et c’est lors de cette dispersion qu’ils peuvent interagir avec les humains et les animaux », explique-t-elle.
Quoi qu’il en soit, elle souligne que « les infections ont tendance à toucher uniquement la population la plus vulnérable et ne se transmettent pas entre humains. Elles sont plutôt le résultat d’une certaine forme de blessure, entre autres voies d’inoculation ».
Selon Gené, les résultats du projet confirment que les sédiments fluviaux constituent une réserve importante de biodiversité fongique et contiennent des espèces totalement inconnues de la science. Ils constituent donc un patrimoine qui doit être préservé. La principale nouveauté de l’étude est qu’elle a découvert des champignons jusqu’alors non signalés, dont certains se sont révélés étroitement liés à des champignons pathogènes responsables d’infections très graves sur le continent américain.
« Ces résultats nous permettent non seulement de compléter notre compréhension de l’évolution des champignons mais également de déterminer si certains de ces micro-organismes peuvent constituer une menace pour notre santé. La recherche vient de commencer mais plus nous accumulons d’informations à cet égard, plus Nous pourrons déterminer, par exemple, s’il existe un risque potentiel plus élevé dans une zone particulière et si l’accès à certaines zones doit être contrôlé », explique Gene.
L’unité de mycologie et microbiologie environnementale de l’Université Rovira i Virgili étudie les souches de champignons sédimentaires collectées en différents points du cours de diverses rivières catalanes, par exemple le Llobregat, le Ter, le Segre et l’Èbre, ainsi que de petits ruisseaux.
Une fois cultivés en laboratoire, ils sont étudiés pour voir à quoi ils ressemblent, pour comprendre leur potentiel pathogène (c’est-à-dire s’ils peuvent se développer à 36 ou 37 degrés Celsius, la température du corps humain) et pour trouver Découvrez ce qui se passe lorsqu’ils sont confrontés à des cultures de cellules humaines et leur résistance aux médicaments antifongiques.
Tout cela permettra de déterminer si les conditions du changement climatique (sécheresse, températures plus élevées, etc.) leur permettent de proliférer plus facilement et représentent un danger.
Quoi qu’il en soit, Gené souligne qu’il n’y a pas lieu de s’alarmer : « Soyez juste vigilant, oui », dit-elle, puisque ces champignons existent depuis toujours.
« Le fait est que nous les comprenons désormais mieux et que nous pouvons donc envisager de mettre en place des mesures de contrôle environnemental. Mais avant cela, il reste encore beaucoup de travail à faire », explique Gené. Elle conclut en soulignant l’importance de la biodiversité car elle conduit à un plus grand équilibre et, par conséquent, à une meilleure coexistence entre les espèces et à moins de risques pour la santé humaine et environnementale.
La recherche est publié dans le Journal des champignons.
Plus d’information:
Daniel Torres-Garcia et al, Aperçu de certains champignons onygénaliens provenant de sédiments d’eau douce en Espagne et description de nouveaux taxons, Journal des champignons (2023). DOI : 10.3390/jof9121129