Code-barres ADN utilisé pour la première fois pour identifier le genre Caragana dans la famille des légumineuses

Le genre Caragana dans la famille des légumineuses est écologiquement et pharmacologiquement important. Caragana joue un rôle clé dans l’écosystème du désert froid sur tout le continent asiatique. Cependant, l’identification précise des taxons du genre a été difficile.

Dans une étude publiée dans Journal de la systématique et de l’évolutiondes chercheurs du Jardin botanique tropical de Xishuangbanna (XTBG) de l’Académie chinoise des sciences ont cherché à établir une norme de code-barres ADN pour permettre une identification fiable des espèces de Caragana, ce qui facilitera les procédures de contrôle de la qualité, en particulier pour les matériaux à base de plantes hautement fragmentés.

Les chercheurs ont réalisé l’échantillonnage taxonomique le plus complet de ce genre. À l’aide de trois approches analytiques (c’est-à-dire la distance génétique par paires, la similarité de séquence et la méthode de l’arbre phylogénétique), ils ont évalué les performances de quatre régions de codes à barres d’ADN, nrITS, trnH-psbA, matK et rbcL.

Ils ont constaté que la région ITS nucléaire était le code-barres le plus précis et le plus efficace pour distinguer les accessions/espèces de Caragana. Lorsqu’il est utilisé seul ou en combinaison avec trnH-psbA, il a le taux de discrimination le plus élevé et peut distinguer les espèces de Caragana.

De manière inattendue, les marqueurs rbcL + matK du code à barres universel des plantes précédemment recommandés étaient inefficaces comme identifiants pour les espèces de Caragana. Par conséquent, les chercheurs recommandent l’ITS seul ou la concaténation de deux régions (trnH-psbA + ITS) comme codes-barres végétaux à Caragana.

« À notre connaissance, la présente étude est la première tentative d’utilisation du code-barres ADN pour Caragana et ses proches », a déclaré Liu Hongmei de XTBG.