Champignons aquatiques : Objectifs de conservation oubliés

Ils sont toujours là, vivant dans l’eau, où ils jouent un rôle clé dans les réseaux trophiques, dans le cycle des nutriments, de la matière et de l’énergie, et dans la purification de l’eau. Cependant, comme cela arrive avec les organismes qui ont tendance à être discrets et souvent invisibles à l’œil nu, la société les néglige généralement et oublie leur énorme importance dans le soutien et la stabilité des écosystèmes aquatiques. Ce qui est encore plus problématique, c’est qu’on oublie aussi qu’ils sont exposés à un large éventail de menaces provenant des activités humaines. Sans mesures de conservation appropriées, leurs populations peuvent décliner et disparaître comme tous les autres organismes aquatiques plus visibles, avec des conséquences imprévues pour les écosystèmes marins et d’eau douce. C’était l’objet d’une étude menée par une équipe internationale dirigée par des chercheurs du Centre de biologie de l’Académie tchèque des sciences, ainsi que de l’Institut Leibniz d’écologie des eaux douces et des pêches intérieures (IGB) en Allemagne, et de l’Université de Coimbra en Le Portugal.

Dans leur article, publié récemment dans la revue Frontières de l’écologie et de l’environnement, les auteurs ont abordé le problème du manque d’attention envers les champignons aquatiques en tant que cibles potentielles de conservation. « Jusqu’à présent, la Liste rouge de l’UICN des espèces menacées ne comprend des évaluations que pour un petit nombre de champignons, et tous ceux évalués ne comprennent également que des macrochampignons terrestres », déclare Mariyana Vatova, l’un des principaux auteurs de l’étude. « Ce qui complique ces évaluations, c’est que de nombreux groupes de champignons aquatiques sont mal étudiés et que de nombreuses espèces doivent encore être découvertes et décrites. »

Un autre problème est que les rares études axées sur les menaces pour la conservation des champignons aquatiques se limitaient presque exclusivement aux risques liés à la libération de fongicides. « Cependant, de nombreux autres polluants peuvent affecter les champignons et leurs réseaux délicats, tels que les produits pharmaceutiques, les métaux, les microplastiques et la pollution par les nutriments », explique Hans-Peter Grossart de l’IGB, un autre auteur de l’étude. « Ce qui est encore plus inquiétant, c’est que nous ne savons presque rien des autres menaces auxquelles ils sont probablement confrontés. Certaines des principales menaces pour les champignons aquatiques comprennent la modification et la dégradation de l’habitat, les invasions biologiques et le changement climatique. »

Le déclin des champignons peut entraîner une perte totale de leurs fonctions clés dans l’écosystème

De telles menaces peuvent conduire non seulement à des extinctions d’espèces dans les communautés fongiques aquatiques, mais aussi à des déclins de population et même à une perte totale de leurs fonctions clés dans l’écosystème, ce qui peut finalement produire des effets en cascade dans les réseaux trophiques aquatiques. « Malheureusement, en raison de grandes lacunes dans nos connaissances actuelles, de nombreux cas de ce type risquent de ne pas être détectés et de rester cachés », explique Ivan Jarić du Centre de biologie de l’Académie tchèque des sciences. « De telles pertes cryptiques de fonctions écosystémiques peuvent encore aggraver la situation, en entravant notre capacité à mettre en œuvre des mesures de conservation rapides et efficaces. »

L’étude soutient que la conservation des champignons aquatiques n’a pas reçu l’attention nécessaire et qu’elle doit être reconnue de toute urgence comme une priorité de gestion et intégrée dans les cadres de conservation aquatique. « Tous ces efforts de gestion devraient viser à la fois à protéger la diversité fongique et à maintenir leurs fonctions écosystémiques clés », suggère Susana C. Gonçalves de l’Université de Coimbra au Portugal, un autre auteur de l’étude, qui est également membre de l’IUCN SSC. Comité de conservation des champignons. « Une conservation efficace peut probablement être réalisée plus efficacement grâce au concept de conservation des écosystèmes. »

Certaines des mesures de gestion prometteuses suggérées dans l’étude comprennent la réduction et l’interdiction de l’importation de nutriments et de contaminants, le contrôle des voies d’introduction d’espèces aquatiques exotiques envahissantes, la renaturation des plans d’eau, la restauration des habitats clés, le maintien de régimes hydrologiques écologiquement pertinents, l’adoption de politiques strictes, et développer et appliquer de nouveaux essais biologiques fongiques standardisés. Les auteurs soulignent cependant que toutes ces mesures devraient être rationalisées pour tenir compte des particularités des champignons.