Les billes d’immobilisation réversible en phase solide (SPRI) sont largement utilisées pour la construction de bibliothèques de séquençage à haut débit afin de purifier et de récupérer les acides nucléiques. UN nouvelle étude Publié dans Zoonoses a étudié les effets du rapport de billes SPRI, du temps d’incubation et du temps d’élution sur la récupération de l’acide nucléique lors de la construction d’une bibliothèque de séquençage à haut débit d’ADNr 16S complet.
Les effets de différents ratios de billes SPRI, temps d’incubation et temps d’élution ont été comparés pour trois quantités d’échantillon initiales différentes. Une expérience orthogonale L9(33) a été conçue pour déterminer la combinaison optimale de ces facteurs.
Le temps d’incubation de trois facteurs, notamment le rapport des billes SPRI, le temps d’incubation et le temps d’élution, a eu un effet statistiquement significatif sur le taux de récupération pour la quantité initiale d’échantillon de 1 500 ng et 3 000 ng. Les résultats de l’expérience orthogonale ont indiqué que le temps d’incubation avait le plus grand impact parmi les trois facteurs.
Le temps d’incubation influence de manière significative le taux de récupération dans la construction d’une bibliothèque de séquençage à haut débit d’ADNr 16S pleine longueur. L’utilisation de billes SPRI 0,8 ×, 15 minutes d’incubation et 10 minutes d’élution ont abouti au taux de récupération le plus élevé. Les billes SPRI offrent une méthode viable pour récupérer des amplicons d’ADNr 16S complets.
Plus d’information:
Yinmei Li et al, Optimisation de l’utilisation de billes d’immobilisation réversibles en phase solide pour la construction d’une bibliothèque de séquençage d’ADNr 16S pleine longueur à haut débit, Zoonoses (2023). DOI : 10.15212/ZOONOSES-2023-0007
Fourni par Compuscript Ltd