Accélérer l’échange de connaissances en génomique et bioinformatique de la biodiversité africaine

Depuis sa création en 2021, le projet African BioGenome (AfricaBP) a réalisé des progrès significatifs vers son objectif ambitieux de séquencer 100 000 espèces endémiques africaines au cours des 10 prochaines années. Récemment, AfricaBP a signalé la mise en œuvre réussie de l’Open Institute dans la revue Biotechnologie naturelle.

Le cadre de l’AfricaBP Open Institute établira des ateliers librement accessibles dans toute l’Afrique, élaborés en étroite collaboration avec les institutions africaines locales. L’objectif principal de l’Open Institute est de développer des programmes de génomique et de bioinformatique de la biodiversité et de favoriser l’échange de connaissances de base qui tourne autour des exigences des scientifiques africains.

Depuis 2022, l’Open Institute a organisé des ateliers très fréquentés en partenariat avec des institutions et organisations africaines et des partenaires mondiaux tels que l’Université de Port Harcourt (Nigéria), Inqaba Biotechnical Industries (Afrique du Sud) et le Vertebrate Genome Project (États-Unis). respectivement. Plus de 700 participants inscrits venus de 29 pays ont découvert les technologies de pointe qui façonnent le domaine de la biodiversité et de la génomique. Les événements ont donné un aperçu de divers aspects de la génomique et de la bioinformatique, notamment la compréhension des bases de données, outils et ressources génomiques mondiales actuelles.

« Le nombre élevé de candidatures que nous recevons pour chaque atelier montre qu’il existe un besoin et une faim de formation en bioinformatique et en génomique en Afrique. L’Open Institute cherche à répondre à ce problème en rendant les ateliers et les formations accessibles presque gratuitement aux participants », a déclaré le professeur Anne WT Muigai, présidente du projet African BioGenome et professeur à l’Université de la Défense nationale du Kenya, au Kenya.

« L’Institut ouvert de génomique et de bioinformatique du projet African BioGenome, une plateforme de renforcement des capacités et de transfert de connaissances, dote les scientifiques, les étudiants et les institutions locales en Afrique des compétences et des capacités nécessaires pour mener une recherche et un développement durables en matière de bioinformatique, de science des données et de génomique.  » C’est notre contribution à combler les lacunes critiques en matière de compétences humaines, infrastructurelles et techniques qui continuent de limiter les opportunités de tirer parti des innovations scientifiques et technologiques en Afrique », a déclaré le professeur Appolinaire Djikeng, directeur principal des systèmes basés sur l’élevage, CGIAR, directeur général. , Institut international de recherche sur l’élevage (ILRI) et co-fondateur d’AfricaBP.

L’Institut Ouvert d’AfricaBP vise à réduire certains des obstacles qui empêchent l’avancement de l’échange de connaissances en génomique et en bioinformatique à travers l’Afrique en se concentrant sur cinq domaines prioritaires clés :

  • Le développement du curriculum
  • Développement technologique et infrastructure
  • Promouvoir l’échange de connaissances au niveau local et les partenariats équitables
  • Maximiser la propriété et la souveraineté des données
  • Entreprise scientifique et industrie
  • En ce qui concerne l’avenir de l’Open Institute, AfricaBP élargira sa portée pour accroître la représentation des participants de tout le continent, en particulier dans les zones où l’activité génomique est actuellement minime. Les participants aux événements de 2022 ont exprimé leur satisfaction quant à la livraison du matériel et du contenu et se sont montrés intéressés à participer aux ateliers futurs et à venir. Cinq ateliers supplémentaires sont actuellement prévus d’ici fin 2023, dont deux ateliers en ligne et trois ateliers hybrides.

    « L’un des aspects majeurs de l’Institut ouvert AfricaBP de génomique et de bioinformatique réside dans son opportunité à un moment où l’accord sur la Zone de libre-échange continentale africaine (ZLECAf) est déjà en vigueur. Grâce à une telle plateforme d’échange de connaissances, il existe un argument économique et une justification pour les organisations, les agences scientifiques nationales africaines, les partenaires locaux et internationaux, de soutenir cet effort qui maintient l’Afrique sur la bonne voie pour une infrastructure génomique et bioinformatique fédérée qui contribuera à la bioéconomie de l’Afrique », a déclaré le Dr ThankGod Echezona Ebenezer, fondateur & Co. -Président du projet African BioGenome et bioinformaticien à la faculté de médecine clinique de l’Université de Cambridge, Royaume-Uni.

    « En tant que Fondation SFA, nous nous concentrons sur l’amélioration de la quantité, de la qualité et de la productivité de la science en Afrique, ce qui nécessite une main-d’œuvre scientifique qualifiée grâce au développement de leaders scientifiques compétitifs à l’échelle mondiale en Afrique. L’Open Institute sert notre objectif de former les générations futures. de scientifiques qui généreront des données pour éclairer les politiques et le programme de développement de l’Afrique », a déclaré le professeur Tom Kariuki, directeur général de la Fondation Science pour l’Afrique, Kenya.

    Au cours des 10 prochaines années, si le cadre et les orientations de l’Institut ouvert AfricaBP sont mis en œuvre avec succès, on estime que l’Institut ouvert formera au moins 200 000 scientifiques africains en génomique et en bioinformatique. Cela comblera le déficit de capacités infrastructurelles et techniques qui existe dans le domaine de la biodiversité et de la génomique, et constituera une masse critique de chercheurs à travers l’Afrique, faisant ainsi progresser la mission et la vision du projet African BioGenome.

    L’AfricaBP est un partenaire de projet d’affiliation du Earth BioGenome Project et du Vertebrate Genomes Project.

    Plus d’information:
    Abdoallah Sharaf et al, Combler le fossé en matière de génomique et de bioinformatique de la biodiversité africaine, Biotechnologie naturelle (2023). DOI : 10.1038/s41587-023-01933-2

    Fourni par le projet African BioGenome

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