Grimper aux arbres, grues, renversement chimique – la collecte d’échantillons dans les auvents prenait autrefois beaucoup de temps. Les scientifiques du groupe de travail de l’UDE « Aquatic Ecosystem Research » dirigé par le Prof. Dr. Florian Leese ont maintenant eu une idée brillante : peu de temps avant une averse annoncée, ils ont placé quatre préleveurs de pluie sous des chênes, des hêtres, des pins et des mélèzes dans le Diersfordter Wald et dans le Großer Veen dans la région du Bas-Rhin.
En plus de micro-organismes entiers et de petits invertébrés, l’eau collectée contenait également de l’ADN environnemental (eDNA) : des informations génétiques provenant d’organismes de l’environnement qui ont été libérées par exemple par abrasion ou excrétion.
Ce mélange d’ADN de coléoptère, de champignon, de fourmi et de chêne, pour n’en citer que quelques-uns, est ensuite analysé par métabarcodage eDNA : la méthode capture même les plus infimes traces d’informations génétiques, les amplifie et permet l’identification précise de chaque espèce présente dans l’échantillon.
L’équipe de Leese s’est concentrée sur les invertébrés. Et en comparant les analyses ADN avec les animaux réellement découverts dans les préleveurs de pluie, ils ont constaté que sur les 50 espèces détectées, seules sept étaient tombées dans les échantillons en tant que spécimens entiers. « Nous concluons donc que notre méthode fournit en fait un bon aperçu de la biodiversité dans les canopées des arbres », explique le premier auteur Till Macher.
Les biologistes ont également constaté que la composition des espèces variait d’un arbre à l’autre : dans l’ensemble, ils ont pu attribuer 88 % des espèces détectées à un type d’arbre spécifique.
Bien que les chercheurs aient travaillé avec un échantillon de petite taille pour l’instant, les résultats sont convaincants, souligne Leese : « Nos résultats montrent le potentiel du métabarcodage eDNA dans l’eau de pluie en tant que méthode rapide et peu invasive pour mesurer la diversité des invertébrés vivant dans les canopées des arbres. «
L’article est publié dans la revue ADN environnemental.
Plus d’information:
Till-Hendrik Macher et al, Il pleut des espèces : Rainwash eDNA metabarcoding comme méthode peu invasive pour évaluer la diversité des invertébrés de la canopée des arbres, ADN environnemental (2022). DOI : 10.1002/edn3.372
Fourni par Universität Duisburg-Essen