L’équipe de recherche du professeur agrégé Charalampos G. Spilianakis, professeur affilié à l’Institut de biologie moléculaire et de biotechnologie du FORTH, a travaillé à déterminer si l’organisation tridimensionnelle du génome des lymphocytes T peut réguler l'(auto)immunité.
Dans cet effort, la contribution des laboratoires de Christoforos Nikolaou (Département de biologie, Université de Crète, IMBB-FORTH, BSRC Al. Fleming), Sören Franzenburg (Hôpital universitaire Schleswing Holstein, Kiel, Allemagne) et Dariusz Plewczynski (Université de Varsovie , Pologne) a joué un rôle déterminant.
L’équipe de recherche d’Héraklion, en Crète, a créé une souris knock-out spécifique aux lymphocytes T qui porte une délétion du gène Satb1. L’ADN ne se trouve pas nu à l’intérieur de nos cellules mais interagit plutôt avec une multitude de protéines qui l’emballent et le régulent afin de s’adapter à l’intérieur du noyau de la cellule eucaryote.
La protéine SATB1 se lie à la chromatine et régule l’organisation tridimensionnelle du génome des lymphocytes T. Ce modèle de souris présente une auto-immunité généralisée identifiée par des problèmes de pelage et de peau, une inflammation de plusieurs tissus et organes lymphoïdes (thymus et rate).
Utilisant un grand nombre d’approches génomiques, les scientifiques impliqués ont pu montrer que la protéine SATB1 crée essentiellement des réseaux de gènes dans l’espace tridimensionnel du lymphocyte T, et que leur expression est régulée avec une précision énorme.
L’absence de la protéine susmentionnée, un organisateur de la chromatine des lymphocytes T, conduit à une expression dérégulée des gènes immunospécifiques et conduit donc à l’induction d’une inflammation et d’une auto-immunité étendues.
La prochaine étape de l’équipe de recherche, dans le domaine de la recherche sur l’auto-immunité, implique la conception de petites molécules hautement spécifiques à tester pour leur capacité à inhiber l’inflammation et l’auto-immunité, initialement dans un modèle murin et plus tard chez l’homme.
Les données ont été publiées dans Communication Nature.
Plus d’information:
Tomas Zelenka et al, Le réseau d’amplificateurs 3D du génome des cellules T en développement est façonné par SATB1, Communication Nature (2022). DOI : 10.1038/s41467-022-34345-y