Le CABI a joué un rôle de premier plan dans la création d’un nouveau rapport, facilité par le National Biofilms Innovation Centre (NBIC), qui appelle à une « entreprise très ambitieuse » pour créer une biobanque de microbiome qui contribuera de manière significative à l’avancement de la science et à son application à la santé humaine.
Il est prévu que la UK Microbiome Biobank (UKMB), leader mondial, soutiendra les scientifiques universitaires et industriels dans la quête de nouveaux médicaments et de solutions à certains des défis les plus importants auxquels le monde est confronté.
Le Dr Matthew Ryan est responsable principal de la recherche en ressources biologiques au CABI et auteur principal du rapport intitulé « Assurer l’avenir de la recherche et de l’innovation sur le microbiome : le besoin d’infrastructures de biobanque au Royaume-Uni. »
Il est l’un des nombreux scientifiques de diverses institutions britanniques, dont l’Université d’Oxford, l’Université de Cambridge, Rothamsted Research, Unilever et le Natural History Museum, qui estiment que la UK Microbiome Biobank améliorera la compétitivité économique dans les sciences de la vie et la durabilité de notre bioéconomie.
Rôle important dans le maintien de toutes les formes de vie
Le Dr Ryan a déclaré : « Nous savons maintenant que les microbes jouent un rôle incroyablement important dans le maintien de toutes les formes de vie sur Terre et dans le soutien de la santé des humains, des animaux, des plantes et de l’environnement.
« Les microbes ont le potentiel de contribuer à des solutions pour traiter le cancer, les maladies neurodégénératives et métaboliques, la résistance aux antimicrobiens et les pandémies, ainsi qu’à un système agricole durable capable de nourrir la population mondiale croissante tout en contribuant à réduire les émissions de gaz à effet de serre pour atteindre le zéro émission nette. »
Il affirme que pour garantir que nous disposons des ressources nécessaires à la recherche et à l’innovation visant à trouver de telles solutions, nous devons conserver les matériaux sources et les microbes (souches individuelles et communautés), séquencer leurs génomes et mettre le matériel et les données à la disposition des chercheurs d’aujourd’hui et de demain à une échelle qui n’a pas été possible jusqu’à présent.
La nouvelle entreprise deviendra une référence
Le Dr Andrew Morgan, président du groupe consultatif sur l’innovation du microbiome, Innovate UK Business Connect et contributeur indépendant au rapport, a déclaré : « À ce jour, ces activités ont été largement menées en vase clos par différents groupes de recherche, à la fois universitaires et entreprises privées, avec très peu d’efforts pour garantir des normes communes d’échantillonnage, d’extraction d’ADN, de séquençage, de traitement et de gestion des données.
« La nouvelle entreprise établira la référence pour de telles normes, faisant ainsi progresser la rigueur et l’applicabilité de la science du microbiome plus largement et dans tous les principaux secteurs de la recherche sur le microbiome : humain, animal, végétal et environnemental. »
Il a ajouté qu’il s’agit en réalité d’une banque de microbiome One Health UK qui s’intéresse autant à la biobanque qu’aux normes nécessaires à la mise en place et à la gestion d’une telle entreprise et au domaine dans son ensemble.
Le Dr Morgan a déclaré : « En développant et en intégrant de telles normes, l’initiative fournira une vue longitudinale de la diversité microbienne, du métabolisme et de la fonction à mesure qu’ils évoluent potentiellement, nous permettant de répondre à des questions clés sur l’impact au fil du temps des différentes activités, pratiques, interventions et mesures de conservation humaines et, surtout, du changement climatique.
« De plus, si la biodiversité microbienne se perd au fil du temps, en préservant les microbes et les communautés de microbes des environnements clés dans le futur, nous aurons les moyens possibles de restaurer la biodiversité perdue au profit de la santé et du bien-être de la société et de la planète. »
Préserver la biodiversité microbienne pour les générations à venir
Pour établir l’UKMB, le rapport suggère quelques recommandations, notamment la création d’un pôle de coordination central UKMB et d’une base de données avec des « rayons » qui représentent des domaines thématiques tels que la santé humaine, la santé animale, le sol, les plantes et l’environnement, les systèmes alimentaires et les biofilms, y compris le Centre national d’innovation des biofilms.
Le rapport indique également que l’UKMB devra intégrer les infrastructures de biobanque et de collecte de cultures existantes au Royaume-Uni (par exemple, les biobanques médicales, les collections de cultures, les banques de graines, les collections zoologiques et moléculaires) et établir des liens avec d’autres capacités nationales de l’UKRI, les infrastructures européennes et autres et les activités internationales, y compris les organismes de normalisation et de réglementation.
Le Dr Ryan a déclaré : « L’UKMB sera un phare pour la science du microbiome de classe mondiale du Royaume-Uni, un catalyseur d’innovation dans les sciences de la vie aligné sur la Vision 2021 des sciences de la vie du Royaume-Uni, un accélérateur de croissance économique et une ressource qui conservera la biodiversité microbienne pour les générations à venir. »
Plus d’informations :
Ryan et al., Assurer l’avenir de la recherche et de l’innovation sur le microbiome : le besoin d’infrastructures de biobanque au Royaume-Uni, CABI (2024). DOI: 10.1079/20240382445