De nouvelles recherches menées par le programme Bird Friendly Coffee du Smithsonian mettent en lumière un type de biodiversité souvent négligé : les bactéries du sol et les communautés fongiques. Depuis plus de vingt ans, les recherches du Smithsonian montrent que les plantations de café dotées d’arbres d’ombrage protègent davantage la biodiversité que les plantations de café intensifiées en monoculture.
La nouvelle recherche, publié dans Écologie appliquée des sols, montre que les bactéries et les champignons du sol dans les plantations de café réagissent également à l’intensité de la gestion de la plantation.
Pour mener cette recherche, l’équipe a collecté des échantillons de sol dans des plantations de café en Colombie, au Salvador et au Pérou et a utilisé l’analyse ADN pour établir le profil bactérien et fongique du sol dans des plantations soumises à différents régimes de gestion. Ils ont découvert que la culture du café en monoculture modifie le microbiome du sol, tant au niveau de la composition de la communauté que de la diversité des espèces. Mais toutes les plantations de café cultivées à l’ombre ne sont pas identiques.
Les microbiomes du sol des exploitations agricoles dotées d’arbres d’ombrage indigènes étaient également différents de ceux des exploitations agricoles dotées d’espèces d’arbres d’ombrage non indigènes introduites. Les microbiomes du sol dans les régions tropicales sont mal connus, et cette recherche démontre l’incroyable diversité des sols dans les paysages agricoles tropicaux d’Amérique latine.
Cette recherche nous permet également de mieux comprendre l’impact des décisions de gestion des plantations de café sur l’ensemble de l’écosystème agricole, ce qui a un impact sur la production de café et les moyens de subsistance qui en dépendent. Alors que la biodiversité décline à l’échelle mondiale à un rythme alarmant, les paysages agricoles peuvent jouer un rôle important dans la conservation d’espèces et de processus écologiques uniques qui permettent à l’agriculture de prospérer.
Plus d’informations :
Steve Kutos et al., La gestion des exploitations agricoles et les espèces d’arbres d’ombrage influencent les microbiomes des sols de café en Amérique centrale et en Amérique du Sud, Écologie des sols appliquée (2024). DOI: 10.1016/j.apsoil.2024.105571
Fourni par le parc zoologique national Smithsonian