Les microbes conquièrent le prochain environnement extrême : votre micro-ondes

Depuis la révolution industrielle, les microbes ont colonisé avec succès un nouveau type d’habitat après l’autre : par exemple, les marées noires en mer, le plastique flottant dans les océans, les friches industrielles et même l’intérieur de la Station spatiale internationale.

Il s’avère cependant qu’un environnement extrême abritant une communauté spécialisée de microbes hautement adaptés est beaucoup plus proche de chez nous : à l’intérieur des micro-ondes. Cette découverte a été rapportée pour la première fois par des chercheurs espagnols en une étude dans Frontières de la microbiologieCe n’est pas seulement important du point de vue de l’hygiène, mais cela pourrait également inspirer des applications biotechnologiques – si les souches trouvées dans les micro-ondes peuvent être utilisées à bon escient dans des processus industriels qui nécessitent des bactéries particulièrement résistantes.

« Nos résultats révèlent que les micro-ondes domestiques ont un microbiome plus « anthropisé », semblable aux surfaces de cuisine, tandis que les micro-ondes de laboratoire abritent des bactéries plus résistantes aux radiations », a déclaré Daniel Torrent, l’un des auteurs et chercheur à la start-up Darwin Bioprospecting Excellence SL à Paterna, en Espagne.

Torrent et ses collègues ont échantillonné des microbes dans 30 micro-ondes : 10 dans chacune des cuisines individuelles, 10 dans des espaces domestiques partagés (par exemple, des centres d’entreprise, des instituts scientifiques et des cafétérias) et 10 dans des laboratoires de biologie moléculaire et de microbiologie. L’objectif de ce plan d’échantillonnage était de voir si ces communautés microbiennes sont influencées par les interactions alimentaires et les habitudes des utilisateurs.

L’équipe a utilisé deux méthodes complémentaires pour inventorier la diversité microbienne : le séquençage de nouvelle génération et la culture de 101 souches dans cinq milieux différents.

Un microbiome riche en biodiversité à la maison

Au total, les chercheurs ont identifié 747 genres différents au sein de 25 embranchements bactériens. Les embranchements les plus fréquemment rencontrés étaient les Firmicutes, les Actinobacteria et surtout les Proteobacteria.

Ils ont constaté que la composition de la communauté microbienne typique se recoupait partiellement entre les micro-ondes domestiques partagées et celles utilisées dans un seul foyer, alors que les micro-ondes de laboratoire étaient très différentes. La diversité était la plus faible dans les micro-ondes utilisées dans un seul foyer et la plus élevée dans celles utilisées dans les laboratoires.

Les membres des genres Acinetobacter, Bhargavaea, Brevibacterium, Brevundimonas, Dermacoccus, Klebsiella, Pantoea, Pseudoxanthomonas et Rhizobium ont été trouvés uniquement dans les micro-ondes domestiques, tandis qu’Arthrobacter, Enterobacter, Janibacter, Methylobacterium, Neobacillus, Nocardioides, Novosphingobium, Paenibacillus, Peribacillus, Planococcus, Rothia, Sporosarcina et Terribacillus ont été trouvés uniquement dans les micro-ondes domestiques partagés.

Les bactéries Nonomuraea ont été isolées exclusivement à partir de micro-ondes de laboratoire. Delftia, Micrococcus, Deinocococcus et un genre non identifié du phylum Cyanobacteria y étaient également présents, avec des fréquences significativement plus élevées que dans les micro-organismes domestiques.

Les auteurs ont également comparé la diversité observée avec celle des habitats spécialisés rapportés dans la littérature. Comme prévu, le microbiome des micro-ondes ressemblait à celui que l’on trouve sur les surfaces de cuisine classiques.

« Certaines espèces de bactéries présentes dans les micro-ondes domestiques, comme Klebsiella, Enterococcus et Aeromonas, peuvent présenter un risque pour la santé humaine. Cependant, il est important de noter que la population microbienne présente dans les micro-ondes ne présente pas de risque unique ou accru par rapport aux autres surfaces de cuisine courantes », a déclaré Torrent.

Évolution parallèle

Cependant, il s’apparente également au microbiome d’un habitat industriel, à savoir celui des panneaux solaires. Les auteurs ont avancé que le choc thermique constant, le rayonnement électromagnétique et la dessiccation dans des environnements aussi fortement irradiés ont sélectionné à plusieurs reprises des microbes très résistants, de la même manière que dans les micro-ondes.

« Pour le grand public comme pour le personnel de laboratoire, nous recommandons de désinfecter régulièrement les micro-ondes avec une solution d’eau de Javel diluée ou un spray désinfectant disponible dans le commerce. De plus, il est important d’essuyer les surfaces intérieures avec un chiffon humide après chaque utilisation pour éliminer tout résidu et de nettoyer immédiatement les déversements pour éviter la croissance des bactéries », recommande Torrent.