Une nouvelle étude menée par le laboratoire de paléogénétique du Musée d’histoire naturelle Steinhardt de l’Université de Tel-Aviv et de l’Université de Haïfa a analysé l’ADN d’anciens pépins de raisin de cuve locaux découverts lors de fouilles archéologiques dans le Néguev.
Une graine s’est avérée presque identique à la variété Syriki utilisée aujourd’hui pour faire du vin rouge de haute qualité en Grèce et au Liban, tandis qu’une autre graine est un parent de la variété blanche appelée Be’er, qui pousse toujours dans des vignobles déserts dans les dunes de Palmachim.
Exporté en Europe
L’étude génétique a été dirigée par le Dr Pnina Cohen et le Dr Meirav Meiri du laboratoire de paléogénétique du Musée d’histoire naturelle Steinhardt de l’Université de Tel Aviv. Les graines ont été trouvées lors de fouilles archéologiques menées par le professeur Guy Bar-Oz de l’École d’archéologie et des cultures maritimes de l’Université de Haïfa, en collaboration avec des chercheurs de l’Autorité des antiquités d’Israël. Parmi les autres participants figuraient des chercheurs de l’Université de Haïfa, de l’Institut Weizmann, de l’Université Bar-Ilan et d’institutions de recherche en France, au Danemark et au Royaume-Uni. L’article a été publié dans la revue Actes de l’Académie nationale des sciences.
« Fouilles archéologiques menées dans le Néguev [in Israel] ces dernières années ont révélé une industrie viticole florissante des périodes byzantine et arabe (autour du IVe au IXe siècle après JC), en particulier sur les sites de Shivta, Haluza, Avdat et Nizana, qui étaient à l’époque de grandes villes prospères, » déclare le professeur Guy Bar-Oz de l’Université de Haïfa.
« Les découvertes comprennent de grands pressoirs, des cruches dans lesquelles était stocké le vin exclusif, exporté vers l’Europe, et des pépins de raisin conservés pendant plus de mille ans. Cette industrie a progressivement décliné suite à la conquête musulmane au 7ème siècle, puisque l’islam interdit la consommation du vin. »
« La culture du raisin de cuve dans le Néguev n’a été renouvelée qu’à l’époque moderne, dans l’État d’Israël, principalement depuis les années 1980. Cette industrie repose cependant principalement sur des cépages de cuve importés d’Europe. »
Extraction d’ADN
Une découverte particulièrement intéressante était un grand trésor de pépins de raisin, découvert sur le sol d’une pièce scellée à Avdat. Les chercheurs expliquent que ces graines ont été relativement bien conservées grâce à une protection contre les phénomènes climatiques tels que les températures extrêmes, les inondations ou la déshydratation. Pour en savoir plus sur les graines, dans l’espoir de découvrir à quelles variétés elles pourraient appartenir, les chercheurs se sont préparés à extraire leur ADN dans le laboratoire de paléogénétique.
« La science de la paléogénomique utilise une gamme de technologies de pointe pour analyser les génomes anciens, principalement à partir de découvertes archéologiques », explique le Dr Meiri du Musée d’histoire naturelle Steinhardt de l’Université de Tel Aviv.
« La molécule d’ADN étant très sensible et se désintégrant avec le temps, notamment sous des températures élevées, nous n’obtenons généralement que de petits morceaux d’ADN, souvent en mauvais état de conservation. Pour les protéger, nous travaillons dans des conditions particulières : le laboratoire de paléogénétique est un laboratoire isolé laboratoire propre, avec une pression d’air positive qui empêche les contaminants d’entrer, et nous y entrons dans des «combinaisons spatiales» stérilisées familières à tout le monde depuis la pandémie de COVID.
Dans un premier temps, les chercheurs ont recherché toute matière organique restant dans les graines. Pour cela, ils ont utilisé la FTIR (spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier), une technique chimique appliquant un rayonnement infrarouge pour produire un spectre lumineux qui identifie le contenu de l’échantillon. En trouvant des restes de matière organique dans 16 graines, les chercheurs ont ensuite extrait l’ADN de ces échantillons.
Raisins anciens : encore présents aujourd’hui
L’ADN extrait a été séquencé, en mettant l’accent sur environ 10 000 sites génomiques où se trouvent généralement des caractéristiques spécifiques à la variété, et les résultats ont été comparés à des bases de données de vignes modernes du monde entier : Dans 11 échantillons, la qualité du matériel génétique était trop mauvaise pour permettre des conclusions définitives. Trois des échantillons restants ont été identifiés comme appartenant généralement à des variétés locales. Enfin, les deux échantillons de la plus haute qualité, tous deux datant d’environ 900 après JC, ont été identifiés comme appartenant à des variétés locales spécifiques qui existent encore aujourd’hui.
La découverte est assez extraordinaire :
Les petits objets racontent une grande histoire
« Ce qu’il y a de merveilleux avec la paléogénétique, c’est que parfois, de minuscules objets peuvent raconter une grande histoire », explique le Dr Meiri. « C’est exactement ce qui s’est passé dans cette étude. Avec juste un peu d’ADN extrait de deux pépins de raisin, nous avons pu retracer la continuité de l’industrie viticole locale, de la période byzantine, il y a plus de mille ans, à nos jours. »
« Nous pensons que nos découvertes sont également importantes pour l’industrie viticole moderne d’Israël, qui s’est développée et prospère au cours des dernières décennies. Aujourd’hui, la plupart des variétés cultivées ici ont été importées d’Europe, de sorte que les conditions locales ne sont pas optimales pour elles. Variétés locales peut être plus adapté au climat et au sol locaux, en particulier dans la région désertique du Néguev.Notre étude ouvre de nouvelles voies pour restaurer et améliorer les variétés locales anciennes, pour créer des raisins de cuve plus adaptés aux conditions climatiques difficiles telles que les températures élevées et peu de pluie. »
Plus d’information:
Pnina Cohen et al, L’ADN ancien d’un raisin perdu du désert des hautes terres du Néguev révèle une lignée de vin de l’Antiquité tardive, Actes de l’Académie nationale des sciences (2023). DOI : 10.1073/pnas.2213563120