Selon une étude publiée par la revue Rapports scientifiqueslorsque l’anthropisation des ruches diminue, l’abondance relative de leurs bactéries bénéfiques augmente
Dans une étude internationale, le groupe de Génomique Appliquée et Bioinformatique de l’Université du Pays Basque (UPV/EHU) explore la situation des abeilles dans les zones d’agriculture intensive, les zones semi-naturelles et les zones naturelles, en prenant la ruche comme unité. Le pool de micro-organismes des abeilles varie considérablement en fonction du degré d’anthropisation. Après un maintien des ruches dans un habitat semi-naturel pendant 16 jours, leur déséquilibre microbien résultant de l’agriculture a été réduit.
L’abeille domestique occidentale (Apis mellifera) est menacée en raison de nombreux facteurs de stress dont elle souffre dans les zones dépendantes de l’homme, tels qu’une mauvaise alimentation, les pesticides et les agents pathogènes.
« Il est devenu évident au cours des dernières années que la mortalité des abeilles a considérablement augmenté ; c’est pourquoi il y a environ 6 ans, nous avons commencé à examiner quels facteurs influencent le microbiote des abeilles et quelle relation cela a avec les maladies ou la santé des abeilles », a expliqué Iratxe Zarraonaindia. , chercheur Ikerbasque en génomique appliquée et bioinformatique. « Les chercheurs attachent une grande importance à l’anthropisation des territoires, c’est-à-dire « à l’agriculture intensive, aux produits chimiques utilisés, etc.
« En collaboration avec trois universités croates, nous avons eu l’occasion d’étudier quelques ruches situées sur l’île croate d’Unije, loin de l’influence humaine. Ces ruches n’ont subi aucun traitement depuis dix ans ; leurs abeilles étaient connues pour survivre pendant longtemps malgré la présence de l’acarien Varroa, responsable d’une maladie qui cause la maladie et la mort des abeilles. Nous avons voulu étudier comment l’anthropisation influence le microbiote ou communauté de micro-organismes des abeilles. Pour ce faire, nous avons comparé les ruches de l’île de Unije avec le microbiote de deux ruches situées dans des zones rurales », a déclaré Zarraonaindia.
Pour pouvoir comparer les deux ruches de la zone agricole, des « fratries génétiques » (ruches comprenant des abeilles contenant le même matériel génétique que celles de la zone agricole) ont été utilisées, et l’une d’entre elles a été déplacée en zone semi-naturelle.
« L’anthropisation s’est clairement avérée exercer un impact significatif, puisque seulement 16 jours plus tard, nous avons détecté que le déséquilibre microbien dû au stress agricole s’était atténué dans la ruche déplacée vers la zone semi-naturelle », a expliqué le Dr Zarraonaindia. Cela montre que le microbiote des abeilles mellifères a une grande capacité d’adaptation. « Nous ne pensions pas que la composition du microbiote allait changer si rapidement », a-t-elle déclaré.
Les chercheurs ont trouvé un net gradient lié au degré d’anthropisation et à la communauté microbienne de la ruche. « Le microbiote de la ruche de l’île d’Unije est plus équilibré, sa proportion de micro-organismes bénéfiques est plus élevée et en milieu semi-naturel la proportion diminue progressivement, alors qu’en milieu agricole la composition de la ruche est très déséquilibrée, on trouve plus de bactéries opportunistes et il est plus sensible aux maladies », a expliqué Zarraonaindia. Selon le chercheur, « les facteurs de stress dans les zones agricoles sont fortement activés ».
Recherche sur l’apibiome
Ces découvertes ont permis au groupe de recherche de déterminer des biomarqueurs qui fourniront des informations sur la santé des abeilles. Par exemple, les chercheurs ont détecté qu’une bactérie particulière, Arsenophonus, est très répandue dans les zones agricoles, moins présente dans les zones semi-naturelles et très peu présente dans les zones naturelles.
Ils ont étudié la ruche dans son ensemble, pas seulement les abeilles. C’est l’une des clés les plus importantes de cette recherche. « Cette approche est innovante. Nous avons étudié l’apibiome : l’ensemble des micro-organismes dans les niches présentes dans la ruche. Nous avons étudié l’intestin des abeilles, l’entrée de la ruche, le pain d’abeille (la substance dont les abeilles se nourrissent) et l’air à l’intérieur de la ruche. ruche. »
Les bactéries Arsenophonus sont les bactéries les plus répandues dans la zone agricole, et c’est une tendance que l’on retrouve dans toutes les niches. C’est donc un biomarqueur tout à fait approprié pour mesurer l’impact de l’agriculture sur les ruches et mesurer leur état de santé ; de plus, « cette méthode n’est pas invasive, puisqu’elle peut être mise en œuvre en prélevant un échantillon à l’entrée de la ruche ».
Les chercheurs ont publié cette étude dans la revue Rapports scientifiques. La recherche rapportée dans le document ne représente qu’un an de travail. Et les recherches continueront. « Nous avons maintenant déplacé la ruche de la zone semi-naturelle vers une zone naturelle pour voir si le microbiote s’équilibre et se retrouve au même niveau que celui des abeilles dans la zone naturelle. Cela nous dira l’ampleur de l’apport génétique ainsi ainsi que celui de la contribution environnementale. »
Plus d’information:
June Gorrochategui-Ortega et al, Une courte exposition à un habitat semi-naturel atténue le déséquilibre microbien de la ruche causé par le stress agricole, Rapports scientifiques (2022). DOI : 10.1038/s41598-022-23287-6